170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3300 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3300  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  367  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3215  hypothetical protein  97 
 
 
201 aa  299  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3105  hypothetical protein  88.06 
 
 
201 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.247192  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  35.94 
 
 
190 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  38.14 
 
 
202 aa  108  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  41.8 
 
 
544 aa  97.8  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  39.06 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.54 
 
 
208 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  31.25 
 
 
199 aa  91.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  43.84 
 
 
207 aa  91.7  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  43.78 
 
 
207 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.38 
 
 
534 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.87 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  43.35 
 
 
206 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  37.19 
 
 
455 aa  88.2  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.18 
 
 
533 aa  88.2  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  35.42 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  37.63 
 
 
534 aa  87  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.5 
 
 
539 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  37.11 
 
 
534 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  31.41 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  33.66 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.5 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.57 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  36.17 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  38.46 
 
 
575 aa  80.9  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  39.38 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  25 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  36.55 
 
 
534 aa  79.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  32.04 
 
 
185 aa  79  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.32 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.68 
 
 
533 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.02 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  35.94 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.35 
 
 
202 aa  77.4  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.8 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.03 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  32 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  33.16 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  40.43 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  34.54 
 
 
591 aa  72  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  35.35 
 
 
367 aa  71.6  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  37.14 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  36.17 
 
 
384 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.96 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.36 
 
 
538 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  36.26 
 
 
195 aa  70.5  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.72 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.2 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  36.18 
 
 
218 aa  68.6  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.1 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.15 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.97 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.14 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  40.1 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  38.22 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  36.71 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  35.08 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.29 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.46 
 
 
189 aa  65.5  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  35.9 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.32 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  36.7 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  40.91 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.93 
 
 
538 aa  64.3  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.84 
 
 
207 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  28.65 
 
 
368 aa  63.2  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  39.37 
 
 
373 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.31 
 
 
194 aa  62  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  33.02 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  31.55 
 
 
372 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  39.34 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  38.38 
 
 
539 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  34.36 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  36.13 
 
 
459 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  35.23 
 
 
293 aa  58.2  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  34.72 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  34.9 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  28.57 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.62 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  23.32 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.25 
 
 
208 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
393 aa  55.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  27.59 
 
 
216 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.74 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.73 
 
 
208 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  30.61 
 
 
389 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  35.57 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.5 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  35.86 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  36.22 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10391  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.12 
 
 
453 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  30.73 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  28.88 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  36.17 
 
 
200 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  37.44 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  29 
 
 
196 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  34.18 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  28.64 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4334  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  35.95 
 
 
497 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.699537  normal  0.383191 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>