189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3105 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3105  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.247192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3215  hypothetical protein  90 
 
 
201 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3300  hypothetical protein  88.06 
 
 
201 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20416  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  38.34 
 
 
202 aa  111  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  34.9 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  40.21 
 
 
211 aa  101  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  38.46 
 
 
455 aa  95.9  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  31.77 
 
 
199 aa  96.3  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  39.57 
 
 
544 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  34.74 
 
 
198 aa  92.8  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.02 
 
 
534 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  36.36 
 
 
205 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.29 
 
 
533 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.26 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.54 
 
 
208 aa  89  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  44.55 
 
 
206 aa  88.2  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  44.06 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  44 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.64 
 
 
216 aa  85.5  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  37.37 
 
 
534 aa  85.1  7e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  36.17 
 
 
202 aa  84.7  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  36.6 
 
 
534 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  25.26 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.5 
 
 
539 aa  82  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  32.04 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.32 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  38.27 
 
 
575 aa  81.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.46 
 
 
201 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.47 
 
 
197 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.24 
 
 
533 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  31.58 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.21 
 
 
204 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  37 
 
 
534 aa  77.4  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  34.9 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.05 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  35.64 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.22 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.22 
 
 
538 aa  75.9  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  39.49 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.38 
 
 
200 aa  74.3  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.77 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  36.57 
 
 
213 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  35.82 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.68 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.23 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  42.05 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  39.29 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  35.56 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  35.26 
 
 
203 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.78 
 
 
533 aa  68.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.27 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.96 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.3 
 
 
538 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  39.9 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  34.39 
 
 
384 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.85 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.21 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  31.77 
 
 
591 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  31.12 
 
 
370 aa  65.9  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.01 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  40.1 
 
 
200 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  35.48 
 
 
373 aa  65.1  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  35.64 
 
 
194 aa  64.7  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  34.69 
 
 
367 aa  64.7  0.0000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  35.9 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  35.18 
 
 
218 aa  64.3  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  34.47 
 
 
227 aa  62  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.38 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  37 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  27.09 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  34.31 
 
 
212 aa  60.5  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  46.43 
 
 
197 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.77 
 
 
208 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.25 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  28.64 
 
 
408 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  35.38 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.93 
 
 
189 aa  56.2  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  31.25 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  48.67 
 
 
203 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  32.24 
 
 
459 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  37.06 
 
 
539 aa  55.5  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  24.87 
 
 
208 aa  55.1  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  31.75 
 
 
197 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  31.47 
 
 
389 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  43.56 
 
 
546 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  35.96 
 
 
393 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  23.81 
 
 
242 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  29.1 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  38.3 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10391  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  28.12 
 
 
453 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  37.5 
 
 
194 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3519  formate dehydrogenase accessory protein FdhD  36.28 
 
 
229 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.7 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  26.42 
 
 
368 aa  52.4  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  21.89 
 
 
195 aa  52  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  37.5 
 
 
194 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  29.65 
 
 
196 aa  51.6  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  40.88 
 
 
194 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  35.26 
 
 
200 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  37.63 
 
 
192 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>