More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5450 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  100 
 
 
201 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  75.25 
 
 
199 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  67.68 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  60.31 
 
 
197 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  61.34 
 
 
197 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  60.31 
 
 
197 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.3 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.56 
 
 
534 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.32 
 
 
533 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  50.26 
 
 
534 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  49.21 
 
 
533 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  47.09 
 
 
539 aa  141  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  46.6 
 
 
534 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  44.09 
 
 
214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  48.65 
 
 
538 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  43.46 
 
 
534 aa  126  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  47.12 
 
 
455 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  47.09 
 
 
533 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  44.57 
 
 
544 aa  122  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.79 
 
 
194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  46.39 
 
 
546 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.95 
 
 
538 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  42.36 
 
 
210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.31 
 
 
202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.79 
 
 
208 aa  109  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  40.62 
 
 
575 aa  108  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  40.1 
 
 
203 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  29.14 
 
 
242 aa  99.4  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  37.57 
 
 
216 aa  97.8  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  42 
 
 
539 aa  96.7  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  38.07 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  39.25 
 
 
211 aa  95.1  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  41.44 
 
 
187 aa  94  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.94 
 
 
189 aa  93.6  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  42.08 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  40.8 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.42 
 
 
194 aa  89.7  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  32.31 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  36.76 
 
 
205 aa  89  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.25 
 
 
207 aa  87.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.59 
 
 
197 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.2 
 
 
207 aa  85.9  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.5 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  38.42 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  46 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  36.92 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  45.21 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.37 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  30.77 
 
 
204 aa  82.8  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  47.85 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  44.21 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.9 
 
 
225 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  37.57 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  40.7 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  37.22 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  40.11 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  39.59 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  40.31 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  31.16 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  42.55 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  39.78 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  39.89 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.9 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  45.79 
 
 
207 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  45.79 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  45.26 
 
 
206 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  33.69 
 
 
367 aa  75.9  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  40.35 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  40.4 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  40.4 
 
 
198 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  34.38 
 
 
370 aa  75.1  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  30.37 
 
 
389 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  34.81 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.91 
 
 
203 aa  74.7  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  40.31 
 
 
192 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  42.33 
 
 
202 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  35.64 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  37.7 
 
 
459 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  37.56 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  37.95 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  35.83 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.32 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  25.25 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  37.7 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  39.56 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  30.77 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  37.7 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  39.66 
 
 
181 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  34.87 
 
 
384 aa  69.3  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  34.39 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  30.59 
 
 
185 aa  68.9  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  37.7 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  38.42 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  39.89 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  31.55 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  37 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  25.77 
 
 
368 aa  68.2  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  27.04 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  34.03 
 
 
188 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>