147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3725 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  78.65 
 
 		 199 aa  282  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  54.74 
 
 		 195 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  57.29 
 
 		 346 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  57.59 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  57.59 
 
 		 199 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  55.15 
 
 		 195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  57.29 
 
 		 194 aa  181  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  54.69 
 
 		 195 aa  181  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  56.77 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  56.77 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  56.77 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  56.77 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  56.77 
 
 		 194 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  56.25 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  48.69 
 
 		 198 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  56.25 
 
 		 194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  46.6 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  41.12 
 
 		 199 aa  133  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  44.1 
 
 		 202 aa  114  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  41.79 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  41.03 
 
 		 192 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  38.07 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  36.92 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  40.43 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  40.1 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  39.09 
 
 		 210 aa  104  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  39.8 
 
 		 185 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  41.54 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  36.73 
 
 		 197 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  37.56 
 
 		 200 aa  97.8  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  34.52 
 
 		 207 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  36.49 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  36.22 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  37.5 
 
 		 188 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  36.46 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  34.21 
 
 		 194 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.5 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.67 
 
 		 534 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.37 
 
 		 534 aa  85.1  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3943  hypothetical protein  37.31 
 
 		 190 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148213  normal  0.123195 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  35.03 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  35.44 
 
 		 185 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  31.84 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.67 
 
 		 533 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  33.67 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  34.17 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.18 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  32.99 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.31 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  35.5 
 
 		 534 aa  75.5  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  37.37 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  33.17 
 
 		 200 aa  74.3  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.69 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.82 
 
 		 533 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.2 
 
 		 538 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  42.06 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.47 
 
 		 539 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  34.01 
 
 		 233 aa  72  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  34.03 
 
 		 544 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.32 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  32.66 
 
 		 534 aa  69.3  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.9 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.29 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  24.87 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  29.69 
 
 		 455 aa  68.2  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  29.21 
 
 		 372 aa  67.8  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3712  hypothetical protein  32.46 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  30.35 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.44 
 
 		 591 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  33.68 
 
 		 539 aa  66.2  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  30.61 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.71 
 
 		 538 aa  65.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.46 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 367 aa  65.1  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  34.33 
 
 		 218 aa  65.1  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.63 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  31.91 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  38.54 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.5 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  24.87 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.47 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  37.56 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.86 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.86 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.05 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  31.88 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  31.22 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  33.05 
 
 		 546 aa  58.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5193  hypothetical protein  36.57 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  32.31 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.66 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.16 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  27.42 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  34.18 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  39.34 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  30.05 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  32.18 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.87 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>