229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5190 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  46.11 
 
 
204 aa  181  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  47.18 
 
 
199 aa  180  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  43.24 
 
 
190 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  44.62 
 
 
205 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  40.96 
 
 
211 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  41.27 
 
 
204 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  36.46 
 
 
185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  41.27 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  41.27 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  41.27 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.78 
 
 
208 aa  123  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.94 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.22 
 
 
197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  33.68 
 
 
216 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  41.49 
 
 
196 aa  110  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  34.41 
 
 
202 aa  109  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.18 
 
 
202 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.92 
 
 
534 aa  104  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.74 
 
 
194 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.17 
 
 
207 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  31.77 
 
 
455 aa  97.8  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  34.83 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.2 
 
 
533 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 
534 aa  95.5  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  34.39 
 
 
534 aa  95.1  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.31 
 
 
539 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  33.51 
 
 
208 aa  94.4  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  34.97 
 
 
534 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.09 
 
 
533 aa  90.1  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.93 
 
 
204 aa  89.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.41 
 
 
575 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 
538 aa  87.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30 
 
 
208 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  33.33 
 
 
538 aa  87  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  32.46 
 
 
222 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  29.08 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.44 
 
 
225 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  32.47 
 
 
408 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  28.8 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  32.95 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  30.05 
 
 
546 aa  81.6  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  26.9 
 
 
368 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.8 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  30.3 
 
 
200 aa  81.3  0.000000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  31.02 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  31.16 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  32.78 
 
 
187 aa  79.7  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.48 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.98 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  31.79 
 
 
389 aa  77  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  32.98 
 
 
203 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  32.19 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  32.19 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  32.19 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  29.68 
 
 
234 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  29.95 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  31.75 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  31.48 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  25.95 
 
 
242 aa  75.1  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  34.71 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  26.26 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.81 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  33.73 
 
 
544 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  30.82 
 
 
194 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  31.68 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  30.69 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  31.28 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.26 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  32.99 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  29.95 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  31.25 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  34.55 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.69 
 
 
533 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  33.13 
 
 
175 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  33.33 
 
 
194 aa  72  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3105  hypothetical protein  34.72 
 
 
201 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.247192  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.21 
 
 
197 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  31.51 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  27.44 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  33.14 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1260  xanthine dehydrogenase accessory protein pucB  30.05 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3300  hypothetical protein  36.46 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20416  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  32.16 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  27.84 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  26.6 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  36.02 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  28.57 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  32.24 
 
 
245 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  32.24 
 
 
245 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  29.61 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.9 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  27.23 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  28.95 
 
 
393 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.35 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  30.05 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  35.4 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3215  hypothetical protein  35.94 
 
 
201 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>