108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1700 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  100 
 
 
186 aa  357  7e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  32.83 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.76 
 
 
533 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  38.18 
 
 
534 aa  72.8  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  36.18 
 
 
534 aa  71.6  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.84 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  32.63 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.9 
 
 
539 aa  65.5  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  28.8 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  30.81 
 
 
198 aa  63.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.81 
 
 
538 aa  62.4  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.41 
 
 
189 aa  61.6  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  34.22 
 
 
211 aa  61.6  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.69 
 
 
534 aa  61.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  33.16 
 
 
575 aa  61.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.38 
 
 
197 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.02 
 
 
534 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  38.42 
 
 
202 aa  60.5  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.23 
 
 
197 aa  60.5  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  30.54 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  30.37 
 
 
221 aa  59.3  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  29.67 
 
 
243 aa  58.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.85 
 
 
203 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.71 
 
 
533 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.79 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  29.84 
 
 
199 aa  55.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  31.1 
 
 
199 aa  55.1  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  30 
 
 
195 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.98 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  33.15 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  30.69 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  31.35 
 
 
544 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  30.11 
 
 
195 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  34.36 
 
 
197 aa  52  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.25 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  32.62 
 
 
195 aa  51.6  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  29.87 
 
 
199 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  28.49 
 
 
216 aa  51.2  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  31.25 
 
 
455 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  28.88 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  32.11 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  32.11 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  30.18 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  30 
 
 
207 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4554  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.58 
 
 
452 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.362258 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  32.61 
 
 
188 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  35 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  35.29 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  27.78 
 
 
208 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  33.86 
 
 
196 aa  49.3  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  32.07 
 
 
182 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.42 
 
 
208 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.62 
 
 
204 aa  48.5  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  35.23 
 
 
200 aa  48.5  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.43 
 
 
538 aa  48.5  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.42 
 
 
208 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  21.05 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  30.1 
 
 
199 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  30.1 
 
 
199 aa  47.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  34.45 
 
 
194 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  31.94 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  31.32 
 
 
185 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  26.7 
 
 
186 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  34.68 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  35 
 
 
194 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  30.21 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  29.13 
 
 
346 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  24.4 
 
 
202 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  31.82 
 
 
192 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  31.58 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  28.09 
 
 
207 aa  45.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.23 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  24.86 
 
 
190 aa  45.4  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  32.77 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  32.77 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  32.77 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  31.02 
 
 
216 aa  45.4  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  29.8 
 
 
210 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  31.87 
 
 
191 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  30.95 
 
 
201 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  23.56 
 
 
190 aa  44.7  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  33.96 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  32.69 
 
 
197 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3282  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.33 
 
 
456 aa  44.3  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.01 
 
 
208 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  26.14 
 
 
242 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  26.84 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  32.78 
 
 
200 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4174  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
456 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.92756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0010  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.86 
 
 
456 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.771465  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  24.4 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4200  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
458 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.236226  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4228  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.33 
 
 
456 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  31.41 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3057  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.17 
 
 
452 aa  42.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4197  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  32 
 
 
456 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  31.76 
 
 
198 aa  42  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0220  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.91 
 
 
452 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.600609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  30.46 
 
 
198 aa  42  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>