58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3050 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  72.05 
 
 		 228 aa  305  3e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  70.17 
 
 		 234 aa  300  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  55.17 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  55.6 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  55.6 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  55.6 
 
 		 245 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  55.46 
 
 		 221 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  36.73 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  39.37 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  33.74 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  39.01 
 
 		 203 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  32.29 
 
 		 243 aa  95.5  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2225  hypothetical protein  36.55 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  33.75 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  31.82 
 
 		 211 aa  79  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.58 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  27.85 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  29.09 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  26.98 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  26.05 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  32.27 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  30.06 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  30.77 
 
 		 198 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  29.73 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  27.49 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  27.23 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  26.19 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.95 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  27.92 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  25.81 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  28.64 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.46 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  29.53 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  28.8 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  28.72 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  28.7 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  30.18 
 
 		 186 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  20.18 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  31.65 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.85 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.85 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  22.43 
 
 		 394 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.68 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  28.23 
 
 		 208 aa  47.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.98 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.89 
 
 		 538 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  29.73 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.38 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  26.64 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.17 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.77 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  26.73 
 
 		 575 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  25.76 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.83 
 
 		 538 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  26.87 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  24.17 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>