147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0279 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  40.2 
 
 		 221 aa  131  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  28.43 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  32.83 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  29.67 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  28.78 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  28.29 
 
 		 187 aa  74.7  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  27.78 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  30.36 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  24.29 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  23.81 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  31.73 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  27.78 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  26.24 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.88 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.33 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  30.77 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  28.86 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  29.2 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  26.73 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  28.18 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  28.24 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  28.24 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  26.7 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  30.25 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  23.41 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  26.61 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  26.61 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.57 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  34.27 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.52 
 
 		 534 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  27.36 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  22.55 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  27.27 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  27.75 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  24.02 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.09 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  24.75 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  25 
 
 		 538 aa  60.8  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  22.84 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  23.65 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  26.6 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  24.64 
 
 		 534 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  24.87 
 
 		 190 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.51 
 
 		 538 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  23.53 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  25.63 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  25.16 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.41 
 
 		 539 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.12 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  24.32 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  25.48 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  25.81 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  25.85 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  22.12 
 
 		 575 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  26.61 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  25.19 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  25 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  26.87 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.15 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.61 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  23.67 
 
 		 533 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2788  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  30.57 
 
 		 461 aa  52.4  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  24.75 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  29.5 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 544 aa  51.6  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  25 
 
 		 185 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  23.53 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  25.82 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  24.63 
 
 		 534 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  25.16 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  30.35 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  25 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  21.3 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  30.35 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  26.24 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  23.79 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  23.65 
 
 		 534 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  23.18 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2934  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  29.94 
 
 		 461 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  22.5 
 
 		 455 aa  49.3  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  26.24 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  22.86 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  24.02 
 
 		 188 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  25.87 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  22.53 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0067  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.12 
 
 		 449 aa  48.5  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  24.51 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  26.52 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  29.44 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  29.44 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  28.02 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2742  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  28.12 
 
 		 476 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.19388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4605  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.2 
 
 		 452 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0205  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  26.14 
 
 		 458 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0985366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  26.03 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  26.6 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>