130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1413 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  40.93 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  38.29 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  38.29 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  38.29 
 
 		 245 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  37.84 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  38.67 
 
 		 228 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  37.23 
 
 		 234 aa  125  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  39.29 
 
 		 206 aa  121  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  36.73 
 
 		 229 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2225  hypothetical protein  39.91 
 
 		 235 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  30.29 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  35.86 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  34.5 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  31.96 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  32.84 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  32.82 
 
 		 455 aa  78.2  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  33.16 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.06 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  31.73 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.47 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  29.38 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  31.84 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.95 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  28.71 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  28.02 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.82 
 
 		 534 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.09 
 
 		 533 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  30.05 
 
 		 534 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.74 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  30.32 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.02 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.53 
 
 		 534 aa  65.1  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  29.69 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.06 
 
 		 533 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.92 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.62 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  25.87 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  27.23 
 
 		 198 aa  62  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  31.11 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.65 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.61 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  24.88 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  28.28 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  28.22 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.16 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  27.55 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  31.82 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  27.33 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  26.67 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  26.63 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  26.94 
 
 		 534 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  29.74 
 
 		 370 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  25.65 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.48 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  29.95 
 
 		 575 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.02 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  27.72 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  29.32 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.87 
 
 		 539 aa  55.1  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.02 
 
 		 533 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  26.6 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  22.54 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  28.71 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 		 408 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.67 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  26.74 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  24.75 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  26.23 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  29.63 
 
 		 181 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.87 
 
 		 538 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  25.91 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  26.53 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  25.52 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  28.57 
 
 		 389 aa  52  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  27.59 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  29.53 
 
 		 538 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  24.75 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  27.04 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  26.11 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  24.38 
 
 		 384 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  24.4 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  24.61 
 
 		 191 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  28.22 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  25 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  25.45 
 
 		 228 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.9 
 
 		 203 aa  48.1  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  26.26 
 
 		 218 aa  48.1  0.00009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  25.13 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1573  hypothetical protein  26.37 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0210508  normal  0.559729 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  28.93 
 
 		 368 aa  47.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  24.4 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  26.4 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  27.14 
 
 		 393 aa  46.6  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  29.17 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  26.77 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  27.04 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  24.44 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  27.32 
 
 		 372 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>