77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2951 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  100 
 
 		 206 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  38.1 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  39.82 
 
 		 234 aa  128  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  40.45 
 
 		 228 aa  125  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  38.07 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  39.29 
 
 		 202 aa  121  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  39.37 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  37.9 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  36.99 
 
 		 245 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  35.38 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2225  hypothetical protein  39.64 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  36.53 
 
 		 245 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  36.53 
 
 		 245 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  38.42 
 
 		 203 aa  98.6  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  34.2 
 
 		 221 aa  97.4  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  27.63 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  28.86 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.25 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.21 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.19 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  26.19 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  31.44 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  25.91 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  24.86 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.79 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  33.67 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  32.16 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.37 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  29.57 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  29.34 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  25.25 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  27.27 
 
 		 538 aa  55.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  26.37 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  30.11 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  28.95 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.22 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  29.47 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  27.78 
 
 		 455 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  22.68 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  26.2 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  28.43 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  28.5 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  29.85 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  28.88 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.08 
 
 		 534 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.48 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  31.75 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.23 
 
 		 533 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  26.57 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  29.31 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.95 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  26.74 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  26.98 
 
 		 534 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  30.73 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  28.75 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.14 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1573  hypothetical protein  31.12 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0210508  normal  0.559729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  26.88 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  29.75 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  27.42 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.55 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  32 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  28.8 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  27.16 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1484  hypothetical protein  27.23 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.205253  normal  0.364405 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 		 367 aa  43.1  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  31.12 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  28.43 
 
 		 534 aa  42.7  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.8 
 
 		 203 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  29.1 
 
 		 200 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  26.7 
 
 		 194 aa  42  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.87 
 
 		 539 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.98 
 
 		 197 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  26.56 
 
 		 218 aa  42  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  25 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  27.96 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  27.69 
 
 		 534 aa  41.6  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>