More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2199 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  76.22 
 
 
534 aa  773    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  100 
 
 
534 aa  1048    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  76.22 
 
 
533 aa  768    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  74.67 
 
 
534 aa  754    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  74.91 
 
 
533 aa  747    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  89.51 
 
 
534 aa  892    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  73.78 
 
 
533 aa  742    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  56.65 
 
 
544 aa  544  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  48.2 
 
 
539 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  45.68 
 
 
538 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  46.4 
 
 
546 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.78 
 
 
538 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  43.35 
 
 
539 aa  374  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  44.87 
 
 
575 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3468  molybdopterin binding domain-containing protein  56.93 
 
 
348 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.967739 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5449  molybdopterin binding domain-containing protein  60 
 
 
342 aa  336  7e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1756  molybdopterin binding domain protein  57.27 
 
 
341 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195217  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1057  molybdopterin binding domain-containing protein  57.27 
 
 
336 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1187  molybdopterin binding domain  57.58 
 
 
336 aa  325  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262321  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0985  molybdopterin binding domain  57.88 
 
 
336 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.087675  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0046  hypothetical protein  38.82 
 
 
319 aa  226  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0040  hypothetical protein  39.13 
 
 
321 aa  218  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0040  hypothetical protein  39.13 
 
 
401 aa  218  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0587  Fis family transcriptional regulator  42.22 
 
 
334 aa  207  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0332  molybdopterin binding domain-containing protein  42.51 
 
 
336 aa  206  7e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1936  molybdopterin biosynthesis protein  42.22 
 
 
334 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0205763  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1767  molybdopterin binding domain-containing protein  42.32 
 
 
357 aa  200  6e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.885332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2350  putative molybdopterin biosynthesis protein  39.76 
 
 
337 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.294499  normal  0.371201 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1762  molybdopterin biosynthesis protein  35 
 
 
333 aa  176  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.248299  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0660  molybdopterin binding domain-containing protein  38.01 
 
 
329 aa  163  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0642  molybdopterin binding domain protein  36.82 
 
 
347 aa  160  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138777 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0826  molybdopterin binding domain-containing protein  36.76 
 
 
330 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000805611  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1398  molybdopterin binding domain protein  35.85 
 
 
332 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.9 
 
 
202 aa  153  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  42.05 
 
 
210 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1552  molybdopterin binding domain-containing protein  32.7 
 
 
340 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2761  molybdopterin binding domain protein  30.12 
 
 
340 aa  144  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00889272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0997  molybdopterin binding domain-containing protein  31.76 
 
 
340 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1807  molybdopterin binding domain protein  30.5 
 
 
345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2764  molybdopterin binding domain-containing protein  31.46 
 
 
335 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1824  molybdopterin binding domain protein  33.96 
 
 
346 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0289646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0377  molybdopterin binding domain protein  33.85 
 
 
330 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000620361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3441  molybdopterin binding domain protein  32.2 
 
 
340 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.593613  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  43.32 
 
 
202 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0932  molybdopterin binding domain-containing protein  33.55 
 
 
344 aa  135  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0219  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.73 
 
 
341 aa  133  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.416217  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1573  molybdopterin binding domain-containing protein  31 
 
 
339 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.214865  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1563  molybdopterin binding domain protein  31.19 
 
 
340 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.229434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  39.25 
 
 
455 aa  127  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1600  molybdopterin binding domain protein  32.65 
 
 
339 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.511958  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3500  molybdopterin binding domain protein  30.77 
 
 
341 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1027  molybdopterin biosynthesis protein, putative  27.33 
 
 
343 aa  126  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.21 
 
 
208 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  38.42 
 
 
214 aa  123  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3538  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.35 
 
 
341 aa  123  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2046  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.88 
 
 
337 aa  123  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1761  molybdenum cofactor biosynthesis protein, putative  27.88 
 
 
337 aa  123  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.647505  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.79 
 
 
194 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1478  molybdopterin binding domain-containing protein  26.36 
 
 
341 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.81 
 
 
197 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1688  molybdopterin binding domain protein  30.85 
 
 
324 aa  120  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  40.82 
 
 
203 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  38.1 
 
 
216 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.1 
 
 
197 aa  115  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0685  tungsten formylmethanofuran dehydrogenase family protein/molybdopterin binding protein  31.18 
 
 
551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.518875  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.57 
 
 
204 aa  114  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  37.63 
 
 
225 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0025  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  30.03 
 
 
540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.21 
 
 
203 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  40.93 
 
 
196 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.05 
 
 
199 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1437  molybdenum cofactor synthesis domain protein  26.35 
 
 
324 aa  110  5e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1613  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.93 
 
 
547 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  34.03 
 
 
190 aa  106  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.63 
 
 
207 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  39.3 
 
 
218 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1566  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  29.81 
 
 
557 aa  105  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.78 
 
 
197 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  31.21 
 
 
242 aa  103  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  37.57 
 
 
200 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.14 
 
 
197 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0260  molybdopterin binding domain protein  26.84 
 
 
344 aa  102  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.501358  normal  0.241129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  36.17 
 
 
205 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  36.41 
 
 
202 aa  100  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.46 
 
 
201 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  35.05 
 
 
187 aa  100  9e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  38.42 
 
 
211 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  40 
 
 
185 aa  99.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
389 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  34.72 
 
 
408 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0032  molybdopterin binding domain-containing protein  27.63 
 
 
544 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.360956  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  32.26 
 
 
200 aa  95.1  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  35.14 
 
 
191 aa  93.6  8e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2212  molybdopterin binding domain  27.56 
 
 
409 aa  93.6  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000001586  hitchhiker  0.00707587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.24 
 
 
207 aa  93.2  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.57 
 
 
201 aa  92  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  32.98 
 
 
202 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  35.68 
 
 
199 aa  92  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.09 
 
 
189 aa  91.7  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  29.27 
 
 
216 aa  89.7  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>