195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1881 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  380  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  51.61 
 
 
210 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  49.01 
 
 
195 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  53.14 
 
 
193 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  50 
 
 
195 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.74 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.55 
 
 
207 aa  125  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  47.4 
 
 
213 aa  111  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  46.02 
 
 
175 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  46.99 
 
 
193 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  44.44 
 
 
194 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  42.11 
 
 
212 aa  106  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  42.55 
 
 
191 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  41.29 
 
 
227 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  45.45 
 
 
213 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  48.6 
 
 
181 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  40.8 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.43 
 
 
208 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.95 
 
 
202 aa  95.5  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  47.16 
 
 
181 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  47.16 
 
 
181 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  37.43 
 
 
208 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  42.54 
 
 
195 aa  94  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  43.67 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  36.79 
 
 
214 aa  92  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.96 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  47.73 
 
 
181 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  39.11 
 
 
455 aa  89  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  40.61 
 
 
575 aa  88.6  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.42 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  43.35 
 
 
189 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.01 
 
 
216 aa  87  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  36.89 
 
 
534 aa  87.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.22 
 
 
208 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.85 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  38.1 
 
 
211 aa  85.1  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  43.01 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  37.97 
 
 
191 aa  85.5  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  36.28 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.19 
 
 
533 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  30 
 
 
187 aa  82  0.000000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40 
 
 
534 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  39.8 
 
 
544 aa  81.6  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  37.37 
 
 
534 aa  81.6  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  44.44 
 
 
185 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  36.6 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.73 
 
 
533 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  38.42 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.67 
 
 
539 aa  79.3  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  34.5 
 
 
534 aa  78.2  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  29.08 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  36.61 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.71 
 
 
202 aa  77.8  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  37.3 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  40.74 
 
 
196 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  35.57 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  37.85 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.6 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.46 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  37.89 
 
 
201 aa  74.7  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  40 
 
 
546 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  30.85 
 
 
199 aa  74.7  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  35.53 
 
 
222 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  37 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  28.83 
 
 
208 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.1 
 
 
538 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  34.92 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  35.32 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  29.45 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  42.47 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  37.23 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  29.69 
 
 
202 aa  72  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  36.97 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  33.66 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.27 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  35.45 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.32 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  34.41 
 
 
186 aa  70.9  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  36.97 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  29.1 
 
 
368 aa  68.6  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  37.06 
 
 
200 aa  67.8  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  31.05 
 
 
367 aa  67.8  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.04 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.82 
 
 
538 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.65 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  31.07 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.68 
 
 
591 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.47 
 
 
197 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  38.52 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  36.9 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.77 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  39.32 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  29.84 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.04 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  23.37 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  36.36 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  24.06 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  34.34 
 
 
210 aa  65.1  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  26.94 
 
 
408 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  24.74 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>