175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2392 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  73.6 
 
 		 197 aa  304  7e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  50.81 
 
 		 192 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  49.46 
 
 		 188 aa  178  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  51.87 
 
 		 191 aa  174  8e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  45.21 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  48.63 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  47.28 
 
 		 188 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  46.49 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  45.9 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  45.96 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  42.71 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  40.98 
 
 		 190 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  34.52 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  34.52 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  39.79 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  39.79 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  36.45 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  33.85 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  34.05 
 
 		 196 aa  89.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.86 
 
 		 539 aa  88.6  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  34.92 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 		 533 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.63 
 
 		 534 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  35.23 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  37.57 
 
 		 194 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  34.55 
 
 		 455 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  37.57 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  37.57 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  37.57 
 
 		 194 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  35.71 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  43.65 
 
 		 194 aa  85.1  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.01 
 
 		 534 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  44.63 
 
 		 195 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  32.84 
 
 		 216 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  25.52 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  36.84 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.41 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.47 
 
 		 533 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.97 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  36.17 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  30.16 
 
 		 575 aa  79.7  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  32.04 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  32.99 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  29.67 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.67 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  33.87 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  31.32 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.22 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  24.59 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.16 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  41.48 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.99 
 
 		 533 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.96 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.96 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  36.41 
 
 		 346 aa  72  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  36.04 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  29.59 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.99 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  30.77 
 
 		 546 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  28.95 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  29.1 
 
 		 544 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  30.3 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  27.69 
 
 		 534 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  30.26 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  30.65 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.12 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  23.81 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.93 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  30.81 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  31.96 
 
 		 539 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  28.04 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  32.56 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  34.03 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  29.41 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  31.34 
 
 		 389 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.26 
 
 		 538 aa  65.1  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.69 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  34.45 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.13 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1260  xanthine dehydrogenase accessory protein pucB  34.5 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.46 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  30.41 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  30.53 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.83 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  27.36 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.2 
 
 		 538 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  31.32 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  32.43 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  27.33 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  28.16 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  22.28 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  29.35 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.43 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.74 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  29.07 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.66 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  27.46 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.73 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>