107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1260 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1260  xanthine dehydrogenase accessory protein pucB  100 
 
 
212 aa  433  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  37.11 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.52 
 
 
204 aa  97.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.5 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  37.82 
 
 
196 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.27 
 
 
194 aa  82  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.65 
 
 
202 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  34.5 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.17 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  35.57 
 
 
197 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  34.59 
 
 
192 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  32.99 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  30.89 
 
 
190 aa  75.9  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  33.51 
 
 
190 aa  70.9  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  28.99 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  30.3 
 
 
202 aa  67.8  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  35.26 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  28.5 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  31.71 
 
 
188 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  34.52 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  34.16 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  32.07 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  32.16 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  27.18 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  32.31 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  33.94 
 
 
185 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.14 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  31.98 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  31.47 
 
 
188 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  32.28 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.73 
 
 
539 aa  59.7  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  25 
 
 
195 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  24.38 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.8 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.63 
 
 
534 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  30.3 
 
 
222 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  25.62 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.1 
 
 
534 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  30.21 
 
 
212 aa  55.8  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  27.04 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.56 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  28.35 
 
 
575 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  35 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.65 
 
 
214 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  33.51 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1746  hypothetical protein  26.58 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  34.33 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  34.33 
 
 
207 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.65 
 
 
207 aa  52  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  34.33 
 
 
206 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  33.07 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  30.05 
 
 
455 aa  51.2  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  33.07 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.77 
 
 
538 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  33.07 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3963  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  35.82 
 
 
217 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  33.07 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  36.72 
 
 
384 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10376  hypothetical protein  27.41 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000126755  normal  0.572936 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12478  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  34.96 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  27.98 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  29.63 
 
 
201 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  28.04 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  25.73 
 
 
389 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  32.28 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  27.69 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  33.07 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  33.33 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  30.17 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  33.07 
 
 
194 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  23.41 
 
 
394 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.85 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  29.81 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  30.95 
 
 
544 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  32.87 
 
 
195 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  23.35 
 
 
368 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  31.95 
 
 
534 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1381  MobA-like protein  27.27 
 
 
293 aa  46.6  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223593  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.7 
 
 
533 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  25.89 
 
 
221 aa  45.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  34.46 
 
 
195 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  33.09 
 
 
198 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  33.09 
 
 
198 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  29.17 
 
 
534 aa  45.4  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  33.16 
 
 
202 aa  45.1  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  26.71 
 
 
208 aa  45.1  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  33.57 
 
 
195 aa  45.1  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.18 
 
 
538 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.92 
 
 
533 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  26.67 
 
 
202 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  29.27 
 
 
185 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  23.98 
 
 
216 aa  43.9  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  26.85 
 
 
367 aa  43.9  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  26.6 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  30.93 
 
 
373 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.57 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  34.38 
 
 
199 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  28.8 
 
 
459 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  29.35 
 
 
539 aa  42.7  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>