159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2227 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  384  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  92.31 
 
 
195 aa  336  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  76.92 
 
 
195 aa  307  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  69.07 
 
 
194 aa  237  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  69.07 
 
 
194 aa  237  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  69.07 
 
 
194 aa  237  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  67.88 
 
 
346 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  67.53 
 
 
194 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  67.88 
 
 
199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  67.88 
 
 
199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  67.36 
 
 
194 aa  230  9e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  66.49 
 
 
194 aa  228  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  66.15 
 
 
199 aa  224  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  67.53 
 
 
194 aa  221  6e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  52.33 
 
 
198 aa  191  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  55.79 
 
 
198 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  55.79 
 
 
198 aa  181  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  56.77 
 
 
199 aa  177  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  51.06 
 
 
201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  41.58 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  45.31 
 
 
202 aa  114  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  44.92 
 
 
192 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  42.78 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  44.21 
 
 
200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  40.53 
 
 
214 aa  104  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  39.68 
 
 
198 aa  104  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  45.45 
 
 
191 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  35.75 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  37.37 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  37.44 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.65 
 
 
204 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  35.48 
 
 
174 aa  87.8  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  36.84 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  37.76 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  35.52 
 
 
197 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  36.46 
 
 
197 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.38 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  35.45 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  38.1 
 
 
188 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3943  hypothetical protein  37.23 
 
 
190 aa  82  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148213  normal  0.123195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  34.02 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  38.38 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  37.43 
 
 
185 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3712  hypothetical protein  45.45 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  42.86 
 
 
185 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  35.57 
 
 
210 aa  77.8  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  37.89 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  36.84 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.74 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.65 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  38.73 
 
 
213 aa  72  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
367 aa  72  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.9 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.2 
 
 
533 aa  71.2  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  30.21 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.94 
 
 
534 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  35.03 
 
 
200 aa  70.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  32.62 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  33.69 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.64 
 
 
538 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  35.83 
 
 
544 aa  68.6  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.03 
 
 
533 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.28 
 
 
194 aa  67  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  32.98 
 
 
233 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.85 
 
 
534 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.48 
 
 
538 aa  66.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.7 
 
 
203 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  33.85 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.46 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  32.29 
 
 
534 aa  65.5  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  33.33 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  32.81 
 
 
534 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  31.38 
 
 
200 aa  64.7  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  30.69 
 
 
455 aa  64.7  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  31.09 
 
 
210 aa  64.7  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  26.11 
 
 
368 aa  64.7  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  33.51 
 
 
211 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.63 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  29.8 
 
 
408 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.72 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  34.13 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  31.77 
 
 
216 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  29.03 
 
 
187 aa  62.8  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  28.19 
 
 
208 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.75 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  24.57 
 
 
242 aa  62  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.45 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.17 
 
 
213 aa  61.2  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  24.62 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  27.03 
 
 
370 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  36.18 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  34.05 
 
 
539 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.16 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  38.52 
 
 
200 aa  59.3  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.09 
 
 
539 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.94 
 
 
197 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.98 
 
 
207 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  32.68 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.84 
 
 
591 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>