247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1058 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  100 
 
 
197 aa  367  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  94.92 
 
 
197 aa  324  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  83.76 
 
 
197 aa  276  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  64.36 
 
 
203 aa  202  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  60.31 
 
 
201 aa  164  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  58.2 
 
 
199 aa  164  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  50.79 
 
 
538 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  46.39 
 
 
533 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  45.64 
 
 
534 aa  141  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  47.72 
 
 
539 aa  140  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  46.19 
 
 
534 aa  138  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.71 
 
 
202 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.88 
 
 
534 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.36 
 
 
533 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  45.83 
 
 
194 aa  131  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  43.81 
 
 
534 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  47.85 
 
 
544 aa  124  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  43.08 
 
 
546 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  44.5 
 
 
575 aa  121  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.85 
 
 
533 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  43.39 
 
 
455 aa  118  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.15 
 
 
538 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  44.04 
 
 
208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  40.82 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  40.31 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  40.62 
 
 
202 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  40.64 
 
 
216 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  41.71 
 
 
203 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6027  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.58 
 
 
207 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  38.54 
 
 
205 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  40.21 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  43.37 
 
 
539 aa  94.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  39.9 
 
 
218 aa  94.4  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  46.03 
 
 
196 aa  94  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  34.72 
 
 
204 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  32.8 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.27 
 
 
207 aa  92  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  32.28 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  39.51 
 
 
201 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.36 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  27.37 
 
 
242 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.94 
 
 
189 aa  86.3  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  34.24 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.75 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.14 
 
 
204 aa  85.5  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  34.2 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  37.36 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0036  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.21 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.251562 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5614  hypothetical protein  38.76 
 
 
185 aa  80.9  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.5 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  34.5 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  39.09 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  42.55 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  36 
 
 
198 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  34.38 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  36.84 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  29.41 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  43.09 
 
 
190 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  36.92 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  35.26 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  27.04 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  38.38 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  37.82 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.98 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  39.3 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  39.3 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  33 
 
 
384 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  34.57 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2091  molybdopterin binding protein  35.6 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.865191  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.79 
 
 
197 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  27.69 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  32.81 
 
 
372 aa  68.9  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  38.38 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  37.37 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  37.81 
 
 
206 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2113  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  36.69 
 
 
208 aa  67.8  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  26.18 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  38.02 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  38.61 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  32.64 
 
 
198 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
370 aa  66.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  28.98 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.8 
 
 
211 aa  66.2  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0214  hypothetical protein  39.29 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0793  hypothetical protein  35.9 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  35.38 
 
 
186 aa  64.3  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  36.08 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  35.42 
 
 
186 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  34.54 
 
 
210 aa  63.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.1 
 
 
228 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  30.2 
 
 
213 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  34.18 
 
 
188 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  32.18 
 
 
459 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02710  hypothetical protein  28.28 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0815  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  28.28 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02672  hypothetical protein  28.28 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3037  hypothetical protein  28.28 
 
 
192 aa  62  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  32.02 
 
 
202 aa  62  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  25.74 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3010  hypothetical protein  28.28 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>