249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4741 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  410  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  54.86 
 
 
195 aa  147  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  49.74 
 
 
210 aa  141  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  51.61 
 
 
193 aa  141  8e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  54.71 
 
 
184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  50.78 
 
 
195 aa  131  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  50.52 
 
 
193 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  46.84 
 
 
193 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  44.79 
 
 
191 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  42.93 
 
 
227 aa  115  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  47.42 
 
 
200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  47.7 
 
 
194 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  43.23 
 
 
207 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  43.93 
 
 
197 aa  102  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  45.5 
 
 
213 aa  102  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  39.27 
 
 
211 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  41.09 
 
 
211 aa  100  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  43.93 
 
 
197 aa  99.4  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  38.71 
 
 
455 aa  99  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  39 
 
 
212 aa  97.8  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  31.94 
 
 
204 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  39.06 
 
 
202 aa  96.3  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  33.51 
 
 
190 aa  95.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  44.38 
 
 
181 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  29.63 
 
 
204 aa  94  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  38.97 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  35.26 
 
 
534 aa  91.7  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  45.6 
 
 
185 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6199  hypothetical protein  40.18 
 
 
251 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.326394  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.52 
 
 
208 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.18 
 
 
534 aa  90.1  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  40.21 
 
 
189 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  35.23 
 
 
199 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.97 
 
 
208 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.27 
 
 
197 aa  89  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  37.89 
 
 
222 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.09 
 
 
204 aa  89  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3029  molybdenum cofactor biosynthesis protein  38.17 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098074  normal  0.0308859 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.56 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.84 
 
 
534 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  35.79 
 
 
534 aa  85.9  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.54 
 
 
197 aa  84.7  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.75 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  41.62 
 
 
189 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.33 
 
 
197 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  35.82 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  36.96 
 
 
370 aa  82  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.51 
 
 
533 aa  82  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  35.68 
 
 
544 aa  82  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.75 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.21 
 
 
533 aa  81.3  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  35.64 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  37.11 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  45.36 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  45.36 
 
 
181 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  32.81 
 
 
205 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  38.66 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.52 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.2 
 
 
539 aa  79.7  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  35.26 
 
 
198 aa  79  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  45.93 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  36.79 
 
 
538 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  39.15 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  36.32 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  38.14 
 
 
546 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  27.93 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.62 
 
 
201 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.15982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  44.29 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  38.42 
 
 
190 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  37.16 
 
 
367 aa  75.1  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.97 
 
 
189 aa  74.7  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.86 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  33.33 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.86 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0903  hypothetical protein  26.53 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.631928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  32.81 
 
 
575 aa  72.4  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.68 
 
 
591 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0225  hypothetical protein  36.7 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.633552  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5193  hypothetical protein  38.02 
 
 
211 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  35.48 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  34.76 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  35.11 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0328  hypothetical protein  42.63 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0317  hypothetical protein  42.63 
 
 
207 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.449595  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  44.81 
 
 
181 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  31.16 
 
 
373 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1989  hypothetical protein  37.1 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  31.38 
 
 
202 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  29.23 
 
 
216 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  35.68 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  37.77 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  38.14 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  37.56 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  33.52 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0306  hypothetical protein  41.05 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  29.35 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  35.75 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>