122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1300 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1283  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  346  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260926  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1300  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  346  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0119759  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1312  hypothetical protein  96.13 
 
 
181 aa  274  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1662  hypothetical protein  71.43 
 
 
181 aa  209  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4787  hypothetical protein  70.86 
 
 
175 aa  202  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171606  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1827  hypothetical protein  57.3 
 
 
195 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2964  hypothetical protein  53.07 
 
 
196 aa  133  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3976  hypothetical protein  53.3 
 
 
185 aa  121  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2799  hypothetical protein  46.99 
 
 
189 aa  120  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4770  molybdenum cofactor biosynthesis protein  42.37 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  42.69 
 
 
194 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5126  hypothetical protein  47.8 
 
 
184 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  47.16 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10350  hypothetical protein  52.94 
 
 
136 aa  99.4  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.34 
 
 
210 aa  95.5  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4741  hypothetical protein  45.18 
 
 
213 aa  91.3  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2846  hypothetical protein  45.45 
 
 
193 aa  88.2  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.449385  decreased coverage  0.00911048 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  36.02 
 
 
190 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  37.37 
 
 
212 aa  86.3  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  43.65 
 
 
213 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3196  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  39.06 
 
 
211 aa  85.9  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  40.44 
 
 
193 aa  84.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4967  hypothetical protein  35.48 
 
 
193 aa  84  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3415  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  39.36 
 
 
191 aa  79  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2977  hypothetical protein  39.18 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000274563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  39.11 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  35.94 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  32.78 
 
 
211 aa  72  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0328  hypothetical protein  35.64 
 
 
227 aa  71.2  0.000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.92 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.63 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  37.08 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.65 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  30.06 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3203  hypothetical protein  35.71 
 
 
197 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.950597  normal  0.165624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.42 
 
 
202 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2979  hypothetical protein  36.31 
 
 
197 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.220075 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.92 
 
 
534 aa  61.6  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  32.53 
 
 
198 aa  61.6  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  34.55 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  28.04 
 
 
187 aa  60.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  33.16 
 
 
455 aa  59.7  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  35.52 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  36.88 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  26.2 
 
 
389 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2068  hypothetical protein  34.44 
 
 
189 aa  58.2  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.7 
 
 
189 aa  57.8  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  32.22 
 
 
199 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  34.81 
 
 
538 aa  57.8  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.67 
 
 
197 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  21.64 
 
 
204 aa  56.6  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  25.14 
 
 
408 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  29.05 
 
 
221 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.63 
 
 
203 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.89 
 
 
194 aa  54.3  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.46 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.46 
 
 
208 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  27.03 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  33.13 
 
 
534 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  28.35 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  31.08 
 
 
373 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  36.07 
 
 
191 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  30.46 
 
 
196 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  35 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  34.21 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  32.77 
 
 
218 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  32.88 
 
 
228 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  34.88 
 
 
534 aa  52  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  33.14 
 
 
199 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  35.51 
 
 
203 aa  51.2  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  28.34 
 
 
195 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  33.51 
 
 
195 aa  51.2  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.26 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  34.3 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  34.3 
 
 
199 aa  50.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  21.86 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  31.58 
 
 
534 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0984  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.24 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0360339  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  35.57 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  32.61 
 
 
197 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  24.32 
 
 
368 aa  49.3  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.59 
 
 
533 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  30.39 
 
 
192 aa  48.9  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  25 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  33.16 
 
 
200 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.22 
 
 
197 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  29.83 
 
 
185 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  34.3 
 
 
346 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  33.33 
 
 
544 aa  47.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  30.77 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.59 
 
 
533 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  29.65 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.87 
 
 
208 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  29.65 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1689  hypothetical protein  32.43 
 
 
225 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0654906  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  30.9 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  30.81 
 
 
194 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  30.81 
 
 
194 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  30.81 
 
 
194 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.82 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.150492 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>