100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0867 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0867  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2698  hypothetical protein  65.19 
 
 		 174 aa  229  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  60.44 
 
 		 182 aa  203  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3712  hypothetical protein  61.63 
 
 		 188 aa  181  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3943  hypothetical protein  56.52 
 
 		 190 aa  167  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148213  normal  0.123195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2563  hypothetical protein  53.85 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.778302  normal  0.0662213 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  105  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  38.19 
 
 		 216 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  33.5 
 
 		 194 aa  87.8  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  33.51 
 
 		 195 aa  84.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  34.95 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  34.95 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25820  hypothetical protein  35.26 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.708466  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  42.86 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  33.5 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  41.88 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  31.91 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  37.31 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  37.31 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  37.31 
 
 		 346 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  41.53 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  41.53 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  42.37 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  41.53 
 
 		 194 aa  72  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  35.75 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  39.83 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  39.82 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  34.83 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  40.17 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.86 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  39.83 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  42.74 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0418  hypothetical protein  29.63 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159486  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  38.14 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  35.92 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  30.53 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  42.35 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0228  uncharacterized MobA-related protein  29.49 
 
 		 363 aa  60.1  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.73 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  33.61 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  31.58 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1554  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 		 370 aa  57.8  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.307535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  31.22 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  31.97 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.43 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1816  metal dependent phosphohydrolase  26.29 
 
 		 372 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  30 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1582  metal dependent phosphohydrolase  33.1 
 
 		 459 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  32.84 
 
 		 591 aa  54.3  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.32 
 
 		 533 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  27.14 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3453  metal dependent phosphohydrolase  27.63 
 
 		 216 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  26.46 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  27.89 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  29.95 
 
 		 534 aa  51.2  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  28.21 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3547  MobA-like protein-like  27.72 
 
 		 384 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.871069  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  26.23 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  29.79 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  26.42 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  30.05 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  30.53 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.63 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.94 
 
 		 539 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.21 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  30.25 
 
 		 367 aa  48.9  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.4 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  30.85 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.21 
 
 		 534 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  26.9 
 
 		 208 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  28.33 
 
 		 408 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  31.32 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.5 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  30.33 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  29.37 
 
 		 534 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.63 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.59 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  29.9 
 
 		 455 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  37.5 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0360  hypothetical protein  24.71 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000717889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  28.04 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.66 
 
 		 533 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4310  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  31.25 
 
 		 228 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.707183  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0243  MobA-like protein  25.25 
 
 		 216 aa  45.1  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00192406  normal  0.367058 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1816  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 		 423 aa  44.7  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.445922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  29.38 
 
 		 544 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.1 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  26.6 
 
 		 534 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  26.37 
 
 		 575 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3467  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.42 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  27.47 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1779  hypothetical protein  29.67 
 
 		 186 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  25.98 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  30.14 
 
 		 546 aa  42  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  27.72 
 
 		 203 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  23.66 
 
 		 393 aa  42  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1006  metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 373 aa  41.6  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  26.67 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5450  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.84 
 
 		 201 aa  40.8  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.15982 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>