More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1196 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 251 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  40.34 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0102  nucleotidyl transferase  37.29 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  37.04 
 
 		 428 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  37.6 
 
 		 436 aa  106  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  30.65 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  30.36 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2641  Nucleotidyl transferase  32.08 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3032  nucleotidyltransferase family protein  32.08 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  28.45 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  28.45 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0963  nucleotidyl transferase  30.49 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.168083  hitchhiker  0.00146596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  25.4 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  28.98 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  34.94 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0197  nucleotidyl transferase  36.59 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0927184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  30.4 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.28 
 
 		 355 aa  63.9  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2945  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  25.4 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.162368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  24.9 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  25 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0193  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  28.26 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  20.72 
 
 		 411 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  28.05 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0568  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  25.4 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0662  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  25.4 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  28.39 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  25.79 
 
 		 261 aa  62  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1984  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase (O-antigen-related)  25.4 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  24.23 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1959  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  25.9 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0146821  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1961  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  25.4 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  26.61 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1705  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  26.61 
 
 		 249 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10400  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.46 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  29.88 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  30.33 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  30.43 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  30.16 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1881  alpha-D-glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  25.1 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  25.7 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2192  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  25.39 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00604297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  28.1 
 
 		 355 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02245  nucleotidyl transferase  29.03 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.9499  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  23.85 
 
 		 411 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.8 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.1 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  23.72 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4009  nucleotidyl transferase  25.51 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.665213  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.57 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.19 
 
 		 358 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.51 
 
 		 349 aa  58.5  0.00000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  21.46 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2657  nucleotidyl transferase  22.76 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0770  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  28 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0114223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  30.28 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2300  Nucleotidyl transferase  29.75 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.706405  normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  29.05 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  27.31 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  22.67 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1479  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.02 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.279848  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  30.2 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  24.07 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1250  nucleotidyl transferase  29.15 
 
 		 608 aa  57.4  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  24.6 
 
 		 392 aa  57.4  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  28.97 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1423  hypothetical protein  24.49 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  30.36 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2947  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  24.8 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142032  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  20.56 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4603  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  23.48 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.803546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  23.2 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.81 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0846  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  27.6 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0481069  normal  0.191137 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1250  nucleotidyl transferase  23.67 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.396561  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  28.74 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  26.64 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.12 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2767  nucleotidyl transferase  23.33 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.33 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1716  nucleotidyl transferase  34.26 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0694785  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.51 
 
 		 357 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1646  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.233302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  44.19 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  30 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.81 
 
 		 355 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.51 
 
 		 357 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0975  Nucleotidyl transferase  34.26 
 
 		 236 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395928  normal  0.0477553 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  26.56 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2761  Nucleotidyl transferase  23.2 
 
 		 320 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  25.43 
 
 		 324 aa  53.9  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0591  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  25.2 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.157461  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2712  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  25.19 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  27.39 
 
 		 393 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  28.8 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  26.12 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3526  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  26.21 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  26.38 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  27.53 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  27.68 
 
 		 227 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>