291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1312 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  100 
 
 
241 aa  484  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  100 
 
 
241 aa  484  1e-136  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  27.12 
 
 
428 aa  89.7  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  29.65 
 
 
436 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  27.63 
 
 
238 aa  72  0.000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  28.39 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  28.33 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.21 
 
 
393 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  28.45 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  26.12 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0102  nucleotidyl transferase  27.95 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  25.96 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  34.82 
 
 
245 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0792  Nucleotidyl transferase  28.1 
 
 
237 aa  63.2  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  28.02 
 
 
243 aa  62  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  25.1 
 
 
393 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  27.16 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.1 
 
 
393 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  25.77 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  25.44 
 
 
391 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0205  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  32.54 
 
 
458 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0985366  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  24.9 
 
 
246 aa  58.9  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  34.82 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  31.78 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  23.14 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  26.27 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2955  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.4 
 
 
308 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  27.35 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.19 
 
 
400 aa  56.6  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  22.82 
 
 
401 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.65 
 
 
349 aa  56.2  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  24.27 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  28.94 
 
 
243 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.69 
 
 
405 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  23.36 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2652  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.74 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  21.43 
 
 
355 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  26.14 
 
 
403 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.33 
 
 
397 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21091  dTDP-glucose pyrophosphorylase  25.32 
 
 
296 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.743902  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  24.18 
 
 
397 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  22.89 
 
 
351 aa  53.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0068  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  32.71 
 
 
466 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.923003  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0637  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  26.13 
 
 
310 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2934  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.27 
 
 
464 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.04737e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.41 
 
 
358 aa  52.4  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.61 
 
 
400 aa  52.4  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  23.97 
 
 
256 aa  52  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.98 
 
 
349 aa  51.2  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  23.38 
 
 
405 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1391  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.89 
 
 
312 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00918938 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  24.19 
 
 
325 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  26.64 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  24.69 
 
 
383 aa  51.2  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  32.14 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  26.72 
 
 
388 aa  51.2  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4288  Nucleotidyl transferase  31.4 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237933  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3961  Nucleotidyl transferase  41.07 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  24.6 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3029  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.23 
 
 
291 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.173381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2758  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.32 
 
 
295 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.03 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  20.97 
 
 
355 aa  49.7  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  23.17 
 
 
400 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.13 
 
 
312 aa  49.7  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3013  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23.53 
 
 
296 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.515318  hitchhiker  0.00164401 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  24 
 
 
384 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1338  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.89 
 
 
312 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.182375  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1403  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.89 
 
 
312 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0784803 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0074  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  30.56 
 
 
458 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.6740700000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2866  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.18 
 
 
295 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  28.77 
 
 
391 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0938  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  27.27 
 
 
290 aa  49.3  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  29.31 
 
 
228 aa  48.9  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  25.62 
 
 
222 aa  48.9  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.27 
 
 
244 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2899  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  23 
 
 
287 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  23.31 
 
 
414 aa  48.9  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0774  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  24.32 
 
 
292 aa  48.9  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0541  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.74 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  20.25 
 
 
399 aa  48.5  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1181  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.96 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25108  normal  0.28241 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0091  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.62 
 
 
458 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.277459  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3012  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.89 
 
 
295 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.635856 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  20.97 
 
 
355 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.41 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  24.9 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  32.14 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.08 
 
 
357 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3241  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  25.62 
 
 
230 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563103  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  28.68 
 
 
403 aa  48.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  24.89 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  20.77 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4076  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.13 
 
 
296 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0532179  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  22.75 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3290  WcbM  25.62 
 
 
230 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  20.49 
 
 
396 aa  47.4  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3859  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.97 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0534  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  25.62 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.140164  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1066  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  25.62 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>