More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1671 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  100 
 
 		 256 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  58.96 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  54.77 
 
 		 262 aa  246  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  52.72 
 
 		 247 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  53.06 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  50.6 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  46.47 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  31.06 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  31.15 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  33.2 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  32.08 
 
 		 254 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  38.73 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  31.17 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  28.63 
 
 		 256 aa  88.2  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  31.56 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  32.38 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  29.32 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  31.43 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  30.74 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  31.43 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  31.43 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  30.67 
 
 		 254 aa  85.1  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  31.43 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  31.43 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  31.43 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  31.43 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  26.8 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  31.43 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  26.69 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  29.73 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  29.51 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  29.2 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  23.77 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  25.1 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  28.98 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.2 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  29.5 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  25.49 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  27.76 
 
 		 630 aa  78.2  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.39 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  31.02 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.29 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  29.39 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.87 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  25.49 
 
 		 564 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.87 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  28.87 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.21 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.87 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.63 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  32.14 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  28.87 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  33.59 
 
 		 400 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  28.87 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  25.78 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  28.12 
 
 		 397 aa  68.9  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  31.33 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.82 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  31.39 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  25.4 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  34.23 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1607  Nucleotidyl transferase  34.11 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0819429  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  50.94 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  28.24 
 
 		 393 aa  65.5  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  26.84 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  28.99 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  33.63 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.15 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  27.52 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  32.14 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  27.48 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  29.77 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  22.66 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  26.42 
 
 		 592 aa  63.5  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  27.75 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  33.64 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  33.64 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 596 aa  63.5  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  30 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0218  nucleotidyl transferase  40.79 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0125725 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14401  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  32.31 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1250  nucleotidyl transferase  27.87 
 
 		 608 aa  62.8  0.000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0088  putative nucleotidyl transferase family protein  45.83 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.781518  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  23.62 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  32.46 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.43 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  29.46 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  29.39 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.79 
 
 		 568 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0385  nucleotidyl transferase  44.44 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4026  putative nucleotidyl transferase  30.18 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.26 
 
 		 545 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.75 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  30.71 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.23 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  35.04 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  27.13 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  30.23 
 
 		 561 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3298  nucleotidyl transferase  32.81 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.998134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>