More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0102 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0102  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 249 aa  497  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  40.68 
 
 		 238 aa  148  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  37.61 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  33.62 
 
 		 436 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  30.7 
 
 		 428 aa  85.5  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1250  nucleotidyl transferase  30.68 
 
 		 608 aa  80.5  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  31.05 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  28.92 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  31.73 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  32.26 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  26.72 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  28.27 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 		 357 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  22.92 
 
 		 414 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  28.9 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  27.9 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  27.19 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  31.37 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  30.37 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  29.67 
 
 		 262 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  30.92 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14740  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  29.37 
 
 		 590 aa  63.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102014 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.1 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  24.17 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  26.84 
 
 		 403 aa  62.4  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  27.95 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  26.17 
 
 		 397 aa  62.4  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  23.08 
 
 		 411 aa  62  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  26.84 
 
 		 363 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  24.78 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  27.2 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  26.53 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1224  HAD superfamily hydrolase  24.8 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.72599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  23.33 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.1 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  30.17 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  28.63 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  23.65 
 
 		 361 aa  60.1  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.76 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  25.84 
 
 		 374 aa  59.3  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  23.55 
 
 		 361 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  23.01 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.05 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  26.29 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  23.24 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  33.49 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  26.69 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.43 
 
 		 356 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.74 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  29.51 
 
 		 384 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  23.67 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  29.08 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  27.37 
 
 		 630 aa  57  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  24.7 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  28.94 
 
 		 365 aa  57  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0437  nucleotidyl transferase  33.49 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  25.54 
 
 		 359 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  39.73 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.17 
 
 		 355 aa  56.2  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  27.71 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.63 
 
 		 357 aa  56.6  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  24.68 
 
 		 400 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51920  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase; GlmU  30.22 
 
 		 454 aa  55.8  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  26.27 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  23.65 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  33.02 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  29.22 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  27.12 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  25 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  23.71 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.1 
 
 		 364 aa  55.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  26.22 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  27.93 
 
 		 401 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  32.26 
 
 		 383 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.27 
 
 		 358 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  28.69 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  25.4 
 
 		 248 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  25.76 
 
 		 397 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  23.73 
 
 		 348 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.47 
 
 		 354 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  25 
 
 		 355 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  28 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  27.87 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.98 
 
 		 357 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  24.37 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  27.53 
 
 		 833 aa  53.9  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  26.16 
 
 		 359 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  34.55 
 
 		 595 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  28.3 
 
 		 393 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  37.23 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.34 
 
 		 534 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  23.55 
 
 		 833 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  28.26 
 
 		 324 aa  53.1  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  25.93 
 
 		 392 aa  53.1  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.61 
 
 		 356 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0074  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.63 
 
 		 458 aa  52.8  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.6740700000000004e-33 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>