149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1807 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  100 
 
 		 251 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  81.93 
 
 		 254 aa  417  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  79.92 
 
 		 254 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  80.31 
 
 		 254 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  80.57 
 
 		 255 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  80.97 
 
 		 255 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  80.57 
 
 		 260 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  80.57 
 
 		 255 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  80.97 
 
 		 255 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  80.57 
 
 		 255 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  80.57 
 
 		 255 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  79.76 
 
 		 255 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  78.54 
 
 		 255 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  78.14 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  78.54 
 
 		 255 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  78.54 
 
 		 255 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  78.14 
 
 		 255 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  78.54 
 
 		 255 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  78.95 
 
 		 255 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  52.23 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  28.1 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  32.24 
 
 		 250 aa  94.4  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  30.74 
 
 		 256 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  29.92 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  30.99 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  25 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.16 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  24.22 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  31.66 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  25.3 
 
 		 630 aa  70.1  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  25.19 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.2 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  35.25 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  23.79 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  28.11 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  23.66 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  27.49 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  26.02 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.2 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  28.51 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  26.27 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  22.78 
 
 		 249 aa  60.8  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  25.61 
 
 		 616 aa  60.1  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  26.12 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  30.08 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  29.41 
 
 		 436 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  26.87 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.54 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  35.46 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  26.1 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  26.75 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50310  sugar nucleotidyltransferase  34.75 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000057924  hitchhiker  0.000309665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1164  sugar nucleotidyltransferases-like protein  26.46 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  30.89 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.22 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  30 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  26.23 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  30.17 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  30.17 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  24.35 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4247  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 240 aa  52  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.432694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  26.21 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  37.07 
 
 		 346 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  26.83 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  33.9 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  31.17 
 
 		 219 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  31.5 
 
 		 400 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  25.78 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  26.14 
 
 		 237 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4008  nucleotidyl transferase  41.77 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 		 326 aa  48.9  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  35.54 
 
 		 226 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  22.14 
 
 		 349 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2615  putative sugar nucleotidyltransferase  28.32 
 
 		 208 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.48 
 
 		 400 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  25.81 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07790  putative nucleotidyl transferase  26.98 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0225083 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2947  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  26.85 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142032  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  31.19 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  24.59 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  40.91 
 
 		 400 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  35.44 
 
 		 596 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5130  nucleotidyl transferase  42.42 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0440  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 		 223 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.792142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.6 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5598  histidinol-phosphate phosphatase family protein  30 
 
 		 649 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  40.98 
 
 		 222 aa  46.2  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  27.52 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0406  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 		 223 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  27.97 
 
 		 384 aa  46.2  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4796  nucleotidyl transferase  42.86 
 
 		 223 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.814441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1538  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  30 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0189  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  30 
 
 		 257 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.544209 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10400  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  31.82 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0565  nucleotidyl transferase  43.94 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3804  nucleotidyl transferase  37.66 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.305091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  31.53 
 
 		 388 aa  45.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2837  nucleotidyl transferase  30.23 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0282356  normal  0.117434 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  28.89 
 
 		 408 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>