More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0726 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  100 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  46.84 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  44.72 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  39.24 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  37.25 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  36.71 
 
 		 253 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  32.8 
 
 		 263 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  35.27 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  31.37 
 
 		 253 aa  136  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  29.67 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  28.97 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  28.97 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  30.49 
 
 		 263 aa  122  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.79 
 
 		 556 aa  102  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  23.72 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  29.02 
 
 		 561 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.51 
 
 		 545 aa  96.3  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.57 
 
 		 561 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.57 
 
 		 561 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.57 
 
 		 561 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.33 
 
 		 562 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  28.02 
 
 		 561 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  28.97 
 
 		 578 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.84 
 
 		 562 aa  92.4  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  30.4 
 
 		 564 aa  91.3  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.8 
 
 		 562 aa  89  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.11 
 
 		 581 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.42 
 
 		 568 aa  87  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2026  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.85 
 
 		 562 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1768  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.85 
 
 		 562 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0691  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.85 
 
 		 562 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1051  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.85 
 
 		 562 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2065  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.85 
 
 		 562 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.226403  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0780  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.85 
 
 		 562 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0758  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.85 
 
 		 562 aa  85.1  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  25.81 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.39 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  29.1 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  24.32 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.58 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  24.7 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0970  Nucleotidyl transferase  22.18 
 
 		 244 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  35.19 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.69 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.51 
 
 		 357 aa  69.7  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  24.69 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  23.89 
 
 		 411 aa  68.6  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  23.08 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  32.77 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  27.87 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1377  putative UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase  30 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  27.46 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  25.32 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.53 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.62 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3074  nucleotidyl transferase  38.76 
 
 		 232 aa  67  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  29.1 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  27.87 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.94 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  27.87 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  27.87 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  27.87 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  27.87 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  27.87 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  27.87 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  31.01 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  27.87 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  47.69 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  24.59 
 
 		 355 aa  64.7  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2814  nucleotidyl transferase  31.44 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.164974  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  46.15 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  46.67 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  31.33 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  27.49 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  27.24 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  34.23 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  32 
 
 		 630 aa  62.8  0.000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.16 
 
 		 355 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  28.28 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  28.28 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  27.46 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0969  nucleotidyl transferase  38.26 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0165491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  23.53 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1084  nucleotidyl transferase  30.73 
 
 		 225 aa  62  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  36.59 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 		 230 aa  62  0.000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  34.26 
 
 		 388 aa  62  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0771  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1022 aa  62  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  29.23 
 
 		 400 aa  61.6  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  33.66 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  27.78 
 
 		 399 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  30.47 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1051  nucleotidyl transferase  30.73 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00300889  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3307  Nucleotidyl transferase  30.73 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.276059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  27.17 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>