184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4299 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  511  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  94.88 
 
 
254 aa  490  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  85.04 
 
 
254 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  81.93 
 
 
251 aa  417  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  78.71 
 
 
255 aa  388  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  77.91 
 
 
255 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  77.91 
 
 
255 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  77.91 
 
 
255 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  77.51 
 
 
255 aa  384  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  77.51 
 
 
255 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  77.91 
 
 
255 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  77.91 
 
 
255 aa  384  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  77.51 
 
 
255 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  77.51 
 
 
255 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  77.51 
 
 
260 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  77.51 
 
 
255 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  77.51 
 
 
255 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  77.51 
 
 
255 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  76.71 
 
 
255 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  52.19 
 
 
256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  33.86 
 
 
250 aa  102  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  30.71 
 
 
241 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  33.2 
 
 
256 aa  95.5  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  31.1 
 
 
246 aa  85.1  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  33.2 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  26.56 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  29.51 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  28.8 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  31.16 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  23.46 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  36.59 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  22.18 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.52 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  31.15 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  25.69 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  24.7 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  22.31 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  33.9 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  27.24 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.27 
 
 
225 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  33.9 
 
 
227 aa  63.2  0.000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  26.27 
 
 
616 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  22.96 
 
 
630 aa  61.6  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  28.06 
 
 
263 aa  60.1  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.91 
 
 
244 aa  59.7  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3392  transferase, putative  28.57 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  26.88 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  22.31 
 
 
247 aa  58.5  0.00000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  29.84 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  25.51 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  24.58 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1212  di-myo-inositol-1,3'-phosphate-1'-phosphate synthase / CTP:L-myo-inositol-1-phosphate cytidylyltransferase  28.79 
 
 
436 aa  57.4  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.4 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  36.17 
 
 
270 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  32 
 
 
400 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  29.92 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  22.27 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.52 
 
 
400 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.52 
 
 
400 aa  55.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  27.8 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  37.19 
 
 
226 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  36.13 
 
 
346 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1196  Nucleotidyl transferase  28.8 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  27.86 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3244  nucleotidyl transferase  32.17 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  25.61 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0197  hypothetical protein  32.3 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.950311  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10400  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  35.48 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  28.8 
 
 
228 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0492  nucleotidyl transferase  38.36 
 
 
245 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021214 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  35.48 
 
 
828 aa  48.9  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4442  Nucleotidyl transferase  36.15 
 
 
306 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1164  sugar nucleotidyltransferases-like protein  24.73 
 
 
294 aa  48.9  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  28.47 
 
 
408 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0149  hypothetical protein  33.61 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  25.1 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  37.7 
 
 
349 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  23.46 
 
 
414 aa  48.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  34.33 
 
 
364 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  34.15 
 
 
364 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  29.2 
 
 
324 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3804  nucleotidyl transferase  39.73 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.305091  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  31.3 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5466  Nucleotidyl transferase  34.17 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  34.33 
 
 
362 aa  47.4  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  31.71 
 
 
326 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.32 
 
 
266 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  25.1 
 
 
428 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  46.15 
 
 
234 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1293  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.87 
 
 
445 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.877486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  28.21 
 
 
247 aa  47  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1162  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  33.87 
 
 
445 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0501738  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0586  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  29.63 
 
 
469 aa  46.6  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000143766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.06 
 
 
240 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2431  Choline/ethanolamine kinase  35 
 
 
595 aa  46.6  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  22.53 
 
 
397 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3436  nucleotidyl transferase  43.08 
 
 
253 aa  46.2  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  27.9 
 
 
245 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  26.12 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  27.94 
 
 
522 aa  45.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>