More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0871 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  100 
 
 		 232 aa  461  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  31.62 
 
 		 262 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  32.6 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  32.6 
 
 		 223 aa  92  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  26.41 
 
 		 246 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  32 
 
 		 227 aa  88.2  9e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.49 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  32 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  28.51 
 
 		 250 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  28.75 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  27.2 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0726  transferase, putative  24.39 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  24.37 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0157  sugar nucleotidyltransferase-like protein  28.05 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000014669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  24.39 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  24.89 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  28.21 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5514  nucleotidyl transferase  25.85 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1406  nucleotidyl transferase  27.53 
 
 		 263 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  26.19 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  24.79 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  26.16 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.25 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  27.66 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  25.1 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  25.52 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  26.29 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  26.29 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  26.75 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  26.29 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  26.29 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  26.29 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  26.29 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29421  hypothetical protein  26.38 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  26.29 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.51 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  24.89 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1003  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 596 aa  65.5  0.0000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0016  transferase, putative  25.74 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  25.1 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0316  putative sugar nucleotidyltransferase  27.49 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.923111  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1908  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.36 
 
 		 562 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4244  sugar nucleotidyltransferases-like  25.41 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  30.13 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3397  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.41 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4122  sugar nucleotidyltransferases-like protein  25.41 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282311  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1415  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  25.91 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.136987  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12410  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  28.1 
 
 		 603 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  25.13 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  24.48 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  26.86 
 
 		 243 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  21.98 
 
 		 411 aa  61.6  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4017  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.51 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2235  2,3-dimethylmalate lyase  27.13 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3536  sugar nucleotidyltransferase-like protein  25.41 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  24.69 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  27.53 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1749  putative sugar-1-phosphate nucleotidyltransferase  25.91 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08320  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  26.89 
 
 		 592 aa  59.7  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.212122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.87 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  24.48 
 
 		 556 aa  59.3  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1913  sugar nucleotidyltransferase-like  25 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0472  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  26.05 
 
 		 428 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1808  2,3-dimethylmalate lyase  23.98 
 
 		 564 aa  59.3  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185861  normal  0.0864763 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  32.58 
 
 		 630 aa  58.9  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.22 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  31.36 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4471  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.36 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111296  normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2947  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142032  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3822  phosphoenolpyruvate phosphomutase  26.1 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.368368 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  25.64 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1161  phosphoenolpyruvate phosphomutase  29.33 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.654999  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  26.03 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  26.58 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1260  cholinephosphate cytidylyltransferase/choline kinase  36.84 
 
 		 522 aa  57  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00193493  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1538  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1914  2,3-dimethylmalate lyase  25.82 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0189  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 257 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.544209 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4245  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.82 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2615  putative sugar nucleotidyltransferase  28.25 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4121  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.82 
 
 		 561 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0795198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1119  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0230664 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3535  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.82 
 
 		 561 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1632  sugar metabolism cluster protein  25.69 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.27 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3661  nucleotidyl transferase  26.56 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4016  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.71 
 
 		 562 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213479  normal  0.855206 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3398  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.82 
 
 		 561 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5999  phosphoenolpyruvate phosphomutase  27.31 
 
 		 581 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.297646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0080  nucleotidyl transferase  28.42 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2073  mannose-1-phosphate guanyltransferase  26.11 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.403503  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.13 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0109  nucleotidyl transferase family protein  26.11 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00238886  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  24.79 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05790  CTP:phosphocholine cytidylyltransferase  25.23 
 
 		 611 aa  53.9  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000926703  hitchhiker  0.00200733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0216  glucose-1-phosphate cytidylyltransferase  38.1 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.800339  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0072  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.155346 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  30.7 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  26.72 
 
 		 230 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  23.75 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>