More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1138 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1138  nucleotidyl transferase  100 
 
 
227 aa  447  1e-125  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.44426 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1337  nucleotidyl transferase  83.77 
 
 
228 aa  396  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0683407  normal  0.343314 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0370  nucleotidyl transferase  80.62 
 
 
227 aa  381  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.357076 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1757  nucleotidyl transferase  80.7 
 
 
228 aa  378  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1489  nucleotidyl transferase  68.33 
 
 
230 aa  316  2e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.523541  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0492  nucleotidyl transferase  69.68 
 
 
230 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000162703 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0999  nucleotidyl transferase  59.01 
 
 
237 aa  266  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.335464  normal  0.356487 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0287  Nucleotidyl transferase  48.66 
 
 
234 aa  217  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1857  nucleotidyl transferase  54.79 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.58805 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0843  nucleotidyl transferase  45.66 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000793597 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  38.99 
 
 
349 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  43.35 
 
 
334 aa  154  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  39.13 
 
 
361 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  38.6 
 
 
854 aa  149  3e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  38.7 
 
 
361 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  38.26 
 
 
361 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3317  Nucleotidyl transferase  39.91 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  0.937142 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  39.13 
 
 
370 aa  146  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  37.12 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2143  putative guanyltransferase  40.81 
 
 
240 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.187528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  38.26 
 
 
370 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  35.9 
 
 
832 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  42.44 
 
 
366 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  36.77 
 
 
820 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  35.47 
 
 
832 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  36.89 
 
 
835 aa  136  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  37.33 
 
 
818 aa  135  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  35.87 
 
 
830 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  38.33 
 
 
820 aa  134  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5131  Nucleotidyl transferase  38.05 
 
 
243 aa  134  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.963114 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  40.59 
 
 
476 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  39.5 
 
 
367 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  37.78 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  35.22 
 
 
841 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  37.78 
 
 
370 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  37.78 
 
 
818 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  38.26 
 
 
238 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  37.93 
 
 
392 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.63 
 
 
842 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  34.78 
 
 
821 aa  130  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  35.15 
 
 
810 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  38.59 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  37.61 
 
 
359 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 
399 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  37.56 
 
 
712 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  37.17 
 
 
359 aa  128  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  35.71 
 
 
828 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  34.38 
 
 
816 aa  128  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  37.78 
 
 
364 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  32.89 
 
 
784 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  34.04 
 
 
833 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  33.94 
 
 
833 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3175  Nucleotidyl transferase  34.8 
 
 
245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673633  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4031  nucleotidyl transferase  34.8 
 
 
245 aa  125  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  35.64 
 
 
776 aa  125  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  38.53 
 
 
357 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.5 
 
 
364 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
834 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
828 aa  124  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  38.8 
 
 
238 aa  124  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  34.09 
 
 
832 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  36 
 
 
363 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  32.47 
 
 
392 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  36.28 
 
 
830 aa  124  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1755  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  36.67 
 
 
223 aa  124  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.385636  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  41.01 
 
 
346 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  34.68 
 
 
347 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  38.25 
 
 
351 aa  124  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  32.89 
 
 
784 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  40 
 
 
359 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  36.4 
 
 
229 aa  123  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  32.89 
 
 
784 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  37.44 
 
 
364 aa  122  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  32.44 
 
 
784 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.44 
 
 
784 aa  123  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.44 
 
 
784 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  32.44 
 
 
784 aa  123  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  32.44 
 
 
784 aa  123  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
359 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  32.33 
 
 
392 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  34.38 
 
 
842 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
359 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  38.33 
 
 
359 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  33.01 
 
 
785 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.36 
 
 
836 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  37.16 
 
 
357 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1422  capsular biosynthesis nucleotidyltransferase, putative  36.67 
 
 
224 aa  122  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  32.17 
 
 
784 aa  122  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  32.17 
 
 
784 aa  121  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  38.38 
 
 
370 aa  121  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  34.1 
 
 
827 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  37.44 
 
 
359 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  35.82 
 
 
843 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  34.36 
 
 
326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  32.47 
 
 
348 aa  119  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  35.32 
 
 
842 aa  119  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  37.04 
 
 
365 aa  119  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.91 
 
 
836 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  38.2 
 
 
238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  36.12 
 
 
362 aa  119  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>