More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4108 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4108  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
243 aa  488  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3867  Nucleotidyl transferase  79.01 
 
 
243 aa  385  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.911834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2534  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  75.31 
 
 
243 aa  360  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.398326  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5001  nucleotidyl transferase  73.33 
 
 
243 aa  360  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0722  nucleotidyltransferase family protein  75.41 
 
 
243 aa  359  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.646872  normal  0.0100327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1354  sugar nucleotidyltransferase-like protein  74.18 
 
 
244 aa  358  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4487  nucleotidyl transferase  72.84 
 
 
243 aa  347  8e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0231829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5681  nucleotidyl transferase  57.08 
 
 
242 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1815  putative nucleotidyl transferase  30.2 
 
 
241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1601  putative nucleotide sugar-1-phosphate transferase  32.37 
 
 
270 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.659292  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3070  nucleotidyl transferase  29.92 
 
 
263 aa  101  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.816945  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2774  nucleotidyl transferase  31.02 
 
 
262 aa  98.2  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1627  hypothetical protein  31.49 
 
 
250 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2240  nucleotidyl transferase  27.97 
 
 
254 aa  92.8  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44310  nucleotidyltransferase family protein  32.78 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.918845  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1671  nucleotidyltransferase family protein  29.63 
 
 
256 aa  89.4  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0753313  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0425  nucleotidyl transferase  25.73 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0438  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  31.67 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1309  nucleotidyl transferase  27.98 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.364184  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0610  nucleotidyl transferase family protein  34.44 
 
 
227 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1841  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.57 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  40.18 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0596  licC protein  33.77 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0116  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  28.27 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.786197  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1279  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  32.08 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3985  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.08 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.755294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  27.85 
 
 
351 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0891  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  30.38 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.202601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1575  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase related protein  29.8 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00205775  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0708  Nucleotidyl transferase  32.06 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.509912  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  24.89 
 
 
238 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  32.8 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7110  transferase  26.21 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  26.19 
 
 
387 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1374  nucleotidyl transferase  26.97 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000214203  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1312  nucleotidyl transferase  26.97 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000203499  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  37.38 
 
 
388 aa  63.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  26.88 
 
 
776 aa  62.8  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0871  sugar nucleotidyltransferase-like protein  24.69 
 
 
232 aa  63.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0497  Nucleotidyl transferase  34.65 
 
 
232 aa  62.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.756206  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.27 
 
 
374 aa  62.4  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  22.42 
 
 
325 aa  62  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  34.82 
 
 
397 aa  62  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  36.52 
 
 
362 aa  61.6  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  23.72 
 
 
330 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2025  hypothetical protein  24.8 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.458858  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  24.89 
 
 
616 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1767  hypothetical protein  24.8 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0781  hypothetical protein  24.8 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2067  ADP-glucose pyrophosphorylase  24.8 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1318  hypothetical protein  25.6 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1907  hypothetical protein  25.2 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0692  hypothetical protein  24.8 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  28.73 
 
 
401 aa  60.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  25.66 
 
 
396 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1807  rfbF; ADP-glucose pyrophosphorylase  26.23 
 
 
251 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191256  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1173  hypothetical protein  28.69 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0210885  normal  0.86006 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0093  sugar nucleotidyltransferase-like protein  38.39 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  30.94 
 
 
325 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1050  hypothetical protein  24.8 
 
 
255 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0757  hypothetical protein  24.8 
 
 
260 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0788  nucleotidyl transferase  26.56 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000772544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.55 
 
 
349 aa  59.7  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2643  nucleotidyl transferase  22.88 
 
 
348 aa  59.3  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3873  nucleotidyl transferase  29.3 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.685638  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0627  hypothetical protein  24.9 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0241988 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0773  nucleotidyl transferase  28.63 
 
 
249 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.924901  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3938  nucleotidyl transferase  28.86 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  36.21 
 
 
397 aa  58.5  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1317  phosphoenolpyruvate phosphomutase  25.39 
 
 
556 aa  58.5  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  25.74 
 
 
360 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  27.23 
 
 
384 aa  58.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  24.79 
 
 
353 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  28.15 
 
 
328 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.01 
 
 
358 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0662  hypothetical protein  22.48 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.490316 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0127  nucleotidyl transferase  39.47 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  26.67 
 
 
392 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3871  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1749  aminotransferase class I and II  27.27 
 
 
630 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.23 
 
 
355 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  25.81 
 
 
357 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.83 
 
 
356 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  30.71 
 
 
234 aa  57.4  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  30.36 
 
 
399 aa  57  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  35.34 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  22.51 
 
 
348 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1459  LicC protein  31.13 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  30.16 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  23.14 
 
 
355 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4299  hypothetical protein  25.61 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.293361  normal  0.44964 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  25.36 
 
 
392 aa  57  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0915  nucleotidyl transferase  41.86 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0053  nucleotidyltransferase protein  31.45 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  30.4 
 
 
393 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  32.85 
 
 
385 aa  56.6  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  30.63 
 
 
400 aa  57  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4470  sugar nucleotidyltransferase-like protein  26.12 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.75477  normal  0.556357 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>