More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4088 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4088  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 351 aa  721    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0598  nucleotidyl transferase  51.15 
 
 		 348 aa  391  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.534705  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0560  nucleotidyl transferase  53.98 
 
 		 351 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2394  nucleotidyl transferase  51.75 
 
 		 346 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2301  nucleotidyl transferase  50.88 
 
 		 348 aa  385  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0051  nucleotidyl transferase  49.71 
 
 		 351 aa  360  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0167  nucleotidyl transferase  50.29 
 
 		 352 aa  358  9e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0256  nucleotidyl transferase  50.29 
 
 		 352 aa  358  9e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3102  mannose-1-phosphate guanyltransferase  49.71 
 
 		 352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001798  D-glycero-D-manno-heptose 1-phosphate guanosyltransferase  50.44 
 
 		 352 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1456  nucleotidyl transferase  50.29 
 
 		 361 aa  355  8.999999999999999e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0633  Nucleotidyl transferase  47.7 
 
 		 353 aa  352  4e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1580  nucleotidyl transferase  48.07 
 
 		 352 aa  348  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.995766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2982  nucleotidyl transferase  47.06 
 
 		 350 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0566081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3126  nucleotidyl transferase  47.06 
 
 		 350 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00676  mannose-1-phosphate guanyltransferase  49.56 
 
 		 352 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0365  Nucleotidyl transferase  49.4 
 
 		 355 aa  339  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2335  putative sugar-phosphate nucleotide transferase  44.77 
 
 		 352 aa  324  1e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0321237  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3979  Nucleotidyl transferase  45.32 
 
 		 360 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2585  nucleotidyl transferase  41.3 
 
 		 367 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000196984 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0529  Nucleotidyl transferase  42.94 
 
 		 352 aa  305  6e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01171  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  46.96 
 
 		 320 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1518  nucleotidyltransferase family protein  39.88 
 
 		 341 aa  296  5e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.973367  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1231  flagellin modification protein PtmE, putative sugar-phosphate nucleotide transferase  41.27 
 
 		 345 aa  292  5e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000208573  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0380  nucleotidyltransferase family protein  38.99 
 
 		 341 aa  289  6e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4857  nucleotidyl transferase  43.03 
 
 		 351 aa  288  7e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.444752  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12391  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  41.21 
 
 		 353 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0812001  normal  0.0145083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1968  nucleotidyltransferase family protein  38.39 
 
 		 476 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142573  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14051  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.59 
 
 		 356 aa  236  3e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.810427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0757  nucleotidyl transferase  36.9 
 
 		 354 aa  222  8e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2643  nucleotidyl transferase  34.22 
 
 		 348 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4077  nucleotidyl transferase  41.36 
 
 		 238 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.957763  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1584  nucleotidyl transferase  40.6 
 
 		 238 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0409  Nucleotidyl transferase  40.91 
 
 		 237 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149684  normal  0.359368 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  38.16 
 
 		 827 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  37.56 
 
 		 818 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  35.4 
 
 		 784 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  35.4 
 
 		 784 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 238 aa  150  4e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  34.96 
 
 		 784 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.96 
 
 		 784 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  34.96 
 
 		 784 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3723  Nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 240 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0885  Nucleotidyl transferase  34.25 
 
 		 229 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  34.96 
 
 		 784 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.96 
 
 		 784 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  34.96 
 
 		 784 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  35.17 
 
 		 820 aa  146  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4321  Nucleotidyl transferase  35.75 
 
 		 238 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0481  nucleotidyl transferase  35.43 
 
 		 267 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  34.51 
 
 		 785 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  34.51 
 
 		 784 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  34.51 
 
 		 784 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  34.32 
 
 		 835 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  35.11 
 
 		 843 aa  143  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.1 
 
 		 349 aa  142  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  33.9 
 
 		 835 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  34.47 
 
 		 835 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 836 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  34.93 
 
 		 830 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 836 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  34.5 
 
 		 832 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  30.36 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.48 
 
 		 837 aa  137  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  33.76 
 
 		 833 aa  135  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  34.68 
 
 		 396 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3557  nucleotidyl transferase  33.04 
 
 		 238 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.567903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.63 
 
 		 836 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  34.06 
 
 		 832 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  33.04 
 
 		 397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  35.4 
 
 		 840 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  34.96 
 
 		 841 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  32.88 
 
 		 854 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  33.93 
 
 		 816 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  34.67 
 
 		 821 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 841 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 834 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  32.49 
 
 		 832 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.78 
 
 		 836 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  35.78 
 
 		 835 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  31.74 
 
 		 820 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  33.78 
 
 		 843 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  33.63 
 
 		 828 aa  129  9.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  32.78 
 
 		 347 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 842 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  33.63 
 
 		 842 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  34.72 
 
 		 810 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  32.91 
 
 		 346 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  34.67 
 
 		 830 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  35.02 
 
 		 347 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  32.47 
 
 		 833 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  30.22 
 
 		 828 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  30.7 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  34.23 
 
 		 391 aa  125  9e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 842 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  30.74 
 
 		 712 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  32.89 
 
 		 828 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  32.88 
 
 		 842 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 818 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.48 
 
 		 828 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>