More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0175 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0175  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 234 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.340342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5632  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  52.84 
 
 		 240 aa  264  7e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4442  Nucleotidyl transferase  47.81 
 
 		 306 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.876023  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3804  nucleotidyl transferase  46.05 
 
 		 305 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.305091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14401  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  46.12 
 
 		 236 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4247  nucleotidyl transferase  40.77 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.432694 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00981  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  42.42 
 
 		 252 aa  185  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.53634 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  34.45 
 
 		 348 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  30.21 
 
 		 359 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3884  nucleotidyl transferase  34.91 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.883067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  32.22 
 
 		 347 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  28.21 
 
 		 359 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  28.21 
 
 		 359 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  28.21 
 
 		 359 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  28.21 
 
 		 359 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  31.93 
 
 		 712 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  29.36 
 
 		 359 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  29.69 
 
 		 347 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 		 349 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  29.29 
 
 		 367 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3313  nucleotidyl transferase  32.91 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.618887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  32.17 
 
 		 820 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  29.06 
 
 		 357 aa  112  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  29.54 
 
 		 833 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  33.62 
 
 		 832 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.69 
 
 		 776 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  29.18 
 
 		 392 aa  108  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  29.58 
 
 		 399 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  29.11 
 
 		 832 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  32.78 
 
 		 810 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.41 
 
 		 400 aa  107  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  29.66 
 
 		 784 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.09 
 
 		 356 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  29.29 
 
 		 784 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  27.12 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  27.12 
 
 		 363 aa  106  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  31.51 
 
 		 816 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  32.31 
 
 		 832 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  29.33 
 
 		 359 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  30.08 
 
 		 381 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.66 
 
 		 784 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  29.66 
 
 		 784 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  29.66 
 
 		 784 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.66 
 
 		 784 aa  104  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  29.66 
 
 		 784 aa  104  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  28.81 
 
 		 366 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  30.86 
 
 		 785 aa  104  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  28.87 
 
 		 784 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  31.38 
 
 		 834 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.46 
 
 		 389 aa  103  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  26.96 
 
 		 357 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  31.35 
 
 		 396 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  28.9 
 
 		 381 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  30.13 
 
 		 828 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  29.29 
 
 		 842 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2356  Nucleotidyl transferase  32.47 
 
 		 310 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.78 
 
 		 357 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.26 
 
 		 354 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  30.67 
 
 		 821 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  30.17 
 
 		 346 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  29.24 
 
 		 784 aa  102  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  27.56 
 
 		 329 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.89 
 
 		 397 aa  101  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.87 
 
 		 784 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.82 
 
 		 355 aa  101  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  29.17 
 
 		 843 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  29.87 
 
 		 835 aa  100  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2761  Nucleotidyl transferase  33.19 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0263  Nucleotidyl transferase  32.49 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  26.78 
 
 		 841 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  29.69 
 
 		 370 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  28.87 
 
 		 842 aa  99.8  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.19 
 
 		 358 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  28.82 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  28.45 
 
 		 842 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  29.63 
 
 		 357 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.39 
 
 		 364 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.38 
 
 		 355 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  28.26 
 
 		 364 aa  99  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.92 
 
 		 357 aa  99  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.75 
 
 		 358 aa  98.6  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.42 
 
 		 400 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  29.64 
 
 		 388 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2007  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  31.9 
 
 		 324 aa  97.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.19 
 
 		 355 aa  97.8  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  33.52 
 
 		 400 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  30.99 
 
 		 397 aa  96.7  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.09 
 
 		 392 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  27.38 
 
 		 388 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  27.38 
 
 		 388 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  28.75 
 
 		 392 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  27.09 
 
 		 392 aa  97.1  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  27.23 
 
 		 392 aa  97.4  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  27.85 
 
 		 830 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  30.61 
 
 		 389 aa  96.7  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  26.78 
 
 		 843 aa  96.3  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  27.11 
 
 		 354 aa  96.3  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  26.87 
 
 		 355 aa  96.3  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  26.72 
 
 		 361 aa  96.3  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  27.78 
 
 		 387 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>