More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1624 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  100 
 
 
367 aa  723    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  48.51 
 
 
366 aa  298  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  42.2 
 
 
370 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  42.47 
 
 
370 aa  285  9e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  39.68 
 
 
370 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  40.66 
 
 
361 aa  266  4e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  40.66 
 
 
361 aa  265  8.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  37.67 
 
 
810 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  40.38 
 
 
361 aa  260  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  41.62 
 
 
821 aa  256  5e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  37.43 
 
 
828 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  35.03 
 
 
776 aa  250  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  40.96 
 
 
349 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  37.43 
 
 
820 aa  249  6e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  36.29 
 
 
818 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  37.57 
 
 
830 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  34.86 
 
 
816 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  40.48 
 
 
364 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  35.34 
 
 
841 aa  238  1e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  40.22 
 
 
363 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  39.24 
 
 
854 aa  236  3e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  40.54 
 
 
347 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  39.67 
 
 
370 aa  237  3e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  36.91 
 
 
841 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  36 
 
 
840 aa  233  5e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  39.05 
 
 
818 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  38.42 
 
 
832 aa  232  1e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
712 aa  230  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  40.6 
 
 
359 aa  229  5e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  37.19 
 
 
832 aa  229  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  38.95 
 
 
359 aa  228  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  35.54 
 
 
833 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  37.87 
 
 
832 aa  227  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  34.06 
 
 
843 aa  228  2e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  36.09 
 
 
834 aa  226  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  35.07 
 
 
842 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  39.3 
 
 
359 aa  226  7e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  35.77 
 
 
830 aa  226  7e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  33.68 
 
 
784 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  32.1 
 
 
835 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.49 
 
 
842 aa  224  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  35.11 
 
 
827 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  33.68 
 
 
784 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.9 
 
 
836 aa  223  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  33.69 
 
 
392 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  33.16 
 
 
784 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  39.08 
 
 
365 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.33 
 
 
828 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  33.16 
 
 
784 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  33.16 
 
 
784 aa  222  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  33.16 
 
 
784 aa  222  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  32.44 
 
 
836 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  34.44 
 
 
842 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.9 
 
 
784 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  36.31 
 
 
828 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  37.43 
 
 
835 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  39.2 
 
 
364 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  34.69 
 
 
820 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  36.96 
 
 
359 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  33.68 
 
 
784 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  38.61 
 
 
357 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.64 
 
 
836 aa  219  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  33.42 
 
 
842 aa  219  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  33.68 
 
 
784 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  35.84 
 
 
347 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  31.13 
 
 
835 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  40.53 
 
 
357 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  32.79 
 
 
785 aa  218  1e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  37.2 
 
 
364 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  31.1 
 
 
835 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  32.18 
 
 
392 aa  216  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  31.28 
 
 
836 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  35.33 
 
 
359 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  36.31 
 
 
348 aa  212  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  31.85 
 
 
784 aa  212  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  34.16 
 
 
843 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  31.69 
 
 
827 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  35.79 
 
 
833 aa  210  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  36.77 
 
 
359 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  28.53 
 
 
392 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  36.77 
 
 
359 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  36.77 
 
 
359 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  39.51 
 
 
351 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 
387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  38.38 
 
 
346 aa  199  7e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.88 
 
 
837 aa  199  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  36.92 
 
 
346 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.81 
 
 
343 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  34.22 
 
 
362 aa  197  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  27.69 
 
 
399 aa  197  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  30.55 
 
 
828 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  32.43 
 
 
387 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  31.42 
 
 
387 aa  195  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  37.92 
 
 
359 aa  192  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  32.79 
 
 
364 aa  186  7e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  30.1 
 
 
364 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  33.97 
 
 
360 aa  181  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0451  nucleotidyl transferase  38.75 
 
 
336 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  35.48 
 
 
326 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  36.64 
 
 
358 aa  181  2e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>