More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0327 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0327  putative nucleotidyl transferase  100 
 
 
381 aa  785    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  64.07 
 
 
397 aa  503  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  54.57 
 
 
388 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  53.3 
 
 
389 aa  408  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  51.97 
 
 
392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  54.57 
 
 
388 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  51.97 
 
 
392 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  51.97 
 
 
392 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  50.79 
 
 
381 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  50 
 
 
392 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  50.56 
 
 
392 aa  398  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  52.29 
 
 
389 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  51.4 
 
 
388 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  52.29 
 
 
388 aa  391  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  49.16 
 
 
392 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  50.28 
 
 
392 aa  389  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  49.16 
 
 
392 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  49.16 
 
 
392 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  52 
 
 
389 aa  387  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  49.16 
 
 
392 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  45.98 
 
 
376 aa  339  5e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  39.42 
 
 
343 aa  250  4e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  36.7 
 
 
828 aa  230  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  38.2 
 
 
820 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  34.48 
 
 
841 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  33.91 
 
 
842 aa  222  7e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  35.89 
 
 
818 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  36.88 
 
 
329 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
842 aa  219  6e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  33.05 
 
 
840 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  35.6 
 
 
816 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  32.76 
 
 
842 aa  216  4e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  34.97 
 
 
821 aa  215  8e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  35.4 
 
 
843 aa  214  9.999999999999999e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
833 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  33.95 
 
 
830 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.61 
 
 
784 aa  208  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  33 
 
 
784 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  35.61 
 
 
784 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.61 
 
 
784 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  32.75 
 
 
784 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  35.61 
 
 
784 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  34.05 
 
 
827 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  35.61 
 
 
784 aa  206  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  35.31 
 
 
784 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  33.59 
 
 
784 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  35.31 
 
 
784 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  35.14 
 
 
818 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  33.24 
 
 
712 aa  202  9e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
827 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  32.82 
 
 
832 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.87 
 
 
836 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  32.94 
 
 
346 aa  199  7e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
833 aa  199  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  32.75 
 
 
836 aa  199  9e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  29.94 
 
 
841 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  35.37 
 
 
810 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  35.31 
 
 
785 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  34.71 
 
 
347 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  33.72 
 
 
832 aa  193  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  32.38 
 
 
830 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  30.75 
 
 
843 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.15 
 
 
828 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  31.59 
 
 
835 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  33.13 
 
 
820 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  31.22 
 
 
835 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  33.64 
 
 
835 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  31 
 
 
835 aa  188  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  32.26 
 
 
832 aa  187  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  30.94 
 
 
836 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  29.02 
 
 
854 aa  186  4e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  30.6 
 
 
828 aa  186  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.91 
 
 
842 aa  186  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  31.6 
 
 
834 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  31.49 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  32.52 
 
 
776 aa  182  7e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  29.44 
 
 
836 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  31.52 
 
 
347 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  30.7 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  30.99 
 
 
361 aa  173  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  31.41 
 
 
349 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  30.64 
 
 
370 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  32.32 
 
 
828 aa  171  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  30.28 
 
 
370 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  31.68 
 
 
370 aa  171  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  30.41 
 
 
361 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.28 
 
 
392 aa  167  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.66 
 
 
837 aa  168  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  28.81 
 
 
367 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  30.77 
 
 
399 aa  160  5e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  27.64 
 
 
366 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
392 aa  147  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  28.13 
 
 
326 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  26.96 
 
 
357 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  29.12 
 
 
392 aa  139  7e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3313  nucleotidyl transferase  34.62 
 
 
262 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.618887 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  28.9 
 
 
387 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  30.47 
 
 
405 aa  136  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  25.82 
 
 
363 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  28.36 
 
 
364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>