More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0529 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  100 
 
 		 400 aa  813    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  87.25 
 
 		 400 aa  719    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  90.5 
 
 		 400 aa  743    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  53.28 
 
 		 397 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  48.37 
 
 		 399 aa  418  1e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  50.13 
 
 		 401 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  47.87 
 
 		 400 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  50.13 
 
 		 396 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  48.12 
 
 		 399 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  49.62 
 
 		 399 aa  378  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  46.73 
 
 		 403 aa  363  2e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  45.14 
 
 		 400 aa  342  7e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  45.61 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  44.97 
 
 		 402 aa  316  4e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  44.42 
 
 		 393 aa  312  7.999999999999999e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  45.69 
 
 		 393 aa  309  6.999999999999999e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.67 
 
 		 405 aa  308  6.999999999999999e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  41.98 
 
 		 411 aa  308  9e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  44.39 
 
 		 439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  41.48 
 
 		 411 aa  306  3e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  42.54 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  44.42 
 
 		 393 aa  305  9.000000000000001e-82  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  44 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  40.74 
 
 		 411 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  45.43 
 
 		 393 aa  300  3e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  40.59 
 
 		 405 aa  295  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  39.66 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  40.15 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.27 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  38.31 
 
 		 393 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  37.9 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  38.92 
 
 		 374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  36.55 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  39.19 
 
 		 384 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  36.62 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  35.22 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  33.5 
 
 		 391 aa  218  2e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  33.5 
 
 		 384 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  34.09 
 
 		 397 aa  209  5e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.58 
 
 		 349 aa  208  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.13 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.01 
 
 		 357 aa  206  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  32.59 
 
 		 397 aa  204  2e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  35.16 
 
 		 388 aa  202  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.64 
 
 		 355 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  35.89 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.24 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.51 
 
 		 355 aa  199  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.21 
 
 		 357 aa  200  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.41 
 
 		 351 aa  199  7e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.28 
 
 		 376 aa  196  8.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.58 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.66 
 
 		 357 aa  194  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  32.1 
 
 		 392 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.57 
 
 		 355 aa  190  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.23 
 
 		 355 aa  189  8e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.69 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.33 
 
 		 354 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.26 
 
 		 355 aa  182  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.44 
 
 		 356 aa  179  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  31.49 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.39 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.63 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.39 
 
 		 357 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  30.5 
 
 		 387 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.71 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.82 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  32.95 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  31.23 
 
 		 361 aa  176  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0099  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.65 
 
 		 456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.749054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  35.63 
 
 		 355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.43 
 
 		 358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.21 
 
 		 356 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  33.53 
 
 		 392 aa  173  5e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  32.39 
 
 		 361 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  32.07 
 
 		 325 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.78 
 
 		 325 aa  172  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.82 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  33.43 
 
 		 347 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.23 
 
 		 353 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.03 
 
 		 355 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  31.98 
 
 		 325 aa  170  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  36 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  30.52 
 
 		 326 aa  169  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.17 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.23 
 
 		 355 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.1 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.33 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  31.19 
 
 		 357 aa  167  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  33.63 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  33.63 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  33.63 
 
 		 359 aa  166  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.9 
 
 		 354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.04 
 
 		 355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  33.52 
 
 		 363 aa  166  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  30 
 
 		 854 aa  166  9e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  30.73 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.46 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  31.32 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.01 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>