More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1855 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  100 
 
 		 370 aa  724    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  75.71 
 
 		 363 aa  543  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  76.84 
 
 		 359 aa  536  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  75.99 
 
 		 359 aa  529  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  75.14 
 
 		 359 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  75.14 
 
 		 359 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  75.14 
 
 		 359 aa  523  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  74.37 
 
 		 359 aa  519  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  63.64 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  67.33 
 
 		 359 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  60.17 
 
 		 365 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  54.97 
 
 		 364 aa  378  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  55.18 
 
 		 364 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  55.96 
 
 		 364 aa  368  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  56.34 
 
 		 357 aa  361  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  57.75 
 
 		 357 aa  358  7e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  53.28 
 
 		 351 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0451  nucleotidyl transferase  55.69 
 
 		 336 aa  332  9e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  38.27 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  41.67 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  39.67 
 
 		 367 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  36.66 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 		 349 aa  232  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  36.39 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  34.68 
 
 		 830 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  34.8 
 
 		 835 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.87 
 
 		 828 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  36.42 
 
 		 827 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  37.17 
 
 		 832 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  36.42 
 
 		 361 aa  216  5e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  36.18 
 
 		 841 aa  216  7e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  38.17 
 
 		 833 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  36.87 
 
 		 843 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  34.6 
 
 		 843 aa  212  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  36.29 
 
 		 854 aa  211  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  36.12 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  33.79 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  35.28 
 
 		 834 aa  209  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  35.41 
 
 		 828 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  34.41 
 
 		 832 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  34.41 
 
 		 832 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  31.1 
 
 		 828 aa  203  4e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  34.98 
 
 		 347 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  34.46 
 
 		 347 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  31.08 
 
 		 840 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.93 
 
 		 842 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  31.78 
 
 		 842 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  29.09 
 
 		 827 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  29.32 
 
 		 820 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  31.9 
 
 		 842 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  34.25 
 
 		 821 aa  196  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  31.51 
 
 		 841 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  30.28 
 
 		 816 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.68 
 
 		 842 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  30.47 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  39.71 
 
 		 346 aa  189  7e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  31.49 
 
 		 836 aa  189  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  31.13 
 
 		 836 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  31.09 
 
 		 776 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  30.06 
 
 		 830 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  29.17 
 
 		 828 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  30.14 
 
 		 810 aa  186  8e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  29.71 
 
 		 818 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  29.4 
 
 		 835 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.97 
 
 		 837 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  28.53 
 
 		 820 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 833 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.3 
 
 		 836 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  29.83 
 
 		 835 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  29.56 
 
 		 836 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  29.44 
 
 		 785 aa  179  8e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  30.03 
 
 		 835 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  28.18 
 
 		 784 aa  177  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  28.89 
 
 		 784 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.89 
 
 		 784 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  28.89 
 
 		 784 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.89 
 
 		 784 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  34.65 
 
 		 326 aa  176  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  28.73 
 
 		 784 aa  176  8e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.61 
 
 		 784 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  28.73 
 
 		 784 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  29.11 
 
 		 784 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  29.11 
 
 		 784 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  28.35 
 
 		 712 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  31.91 
 
 		 818 aa  171  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1971  nucleotidyl transferase  33.9 
 
 		 358 aa  170  4e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0890  nucleotidyl transferase  33.9 
 
 		 359 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  34.5 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  30.7 
 
 		 400 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0928  nucleotidyl transferase  31.61 
 
 		 359 aa  166  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.20613 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  30.45 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1620  nucleotidyl transferase  31.14 
 
 		 360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.131189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  32.94 
 
 		 346 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  29.13 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  27.13 
 
 		 392 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  28.38 
 
 		 387 aa  159  9e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  30.12 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  27.13 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  32.83 
 
 		 392 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  26.93 
 
 		 392 aa  154  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>