More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0505 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  87.25 
 
 
400 aa  719    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  88.25 
 
 
400 aa  719    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  100 
 
 
400 aa  809    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  54.8 
 
 
397 aa  432  1e-120  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  52.41 
 
 
396 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  49.37 
 
 
399 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  51.13 
 
 
401 aa  413  1e-114  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  49.37 
 
 
399 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  48.87 
 
 
400 aa  404  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  49.1 
 
 
399 aa  378  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  48.74 
 
 
403 aa  373  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  47.16 
 
 
400 aa  344  1e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  46.23 
 
 
402 aa  325  9e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  45.34 
 
 
402 aa  320  3e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  42.96 
 
 
411 aa  315  7e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  42.96 
 
 
411 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  43.28 
 
 
414 aa  311  2e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  46.08 
 
 
393 aa  310  4e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  43.4 
 
 
393 aa  310  4e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  45.38 
 
 
439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  41.98 
 
 
411 aa  306  6e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  43 
 
 
405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  40.39 
 
 
411 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  43.15 
 
 
393 aa  301  1e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  44.47 
 
 
403 aa  296  3e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  40.1 
 
 
405 aa  293  3e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  44.19 
 
 
393 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  39.9 
 
 
404 aa  278  9e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  38.81 
 
 
393 aa  276  4e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.16 
 
 
393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  38.48 
 
 
393 aa  268  1e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  40.93 
 
 
374 aa  266  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  37.57 
 
 
384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  36.04 
 
 
383 aa  238  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  37.56 
 
 
385 aa  236  6e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  35.31 
 
 
391 aa  235  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  36.76 
 
 
391 aa  233  3e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  35.25 
 
 
384 aa  229  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  35 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  34 
 
 
397 aa  210  4e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  36.81 
 
 
374 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  35.26 
 
 
388 aa  206  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.31 
 
 
357 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.56 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.66 
 
 
357 aa  201  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.62 
 
 
357 aa  200  5e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  34.17 
 
 
392 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.37 
 
 
355 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.94 
 
 
351 aa  195  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.76 
 
 
376 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.98 
 
 
344 aa  194  2e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.17 
 
 
355 aa  193  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.46 
 
 
355 aa  192  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.43 
 
 
355 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.12 
 
 
357 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  35.86 
 
 
347 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.67 
 
 
349 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.61 
 
 
356 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.22 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  34.8 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.23 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.85 
 
 
355 aa  184  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.42 
 
 
358 aa  182  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.32 
 
 
354 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  32.59 
 
 
387 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.82 
 
 
355 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.82 
 
 
355 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.39 
 
 
359 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36 
 
 
357 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.01 
 
 
356 aa  176  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  31.92 
 
 
361 aa  176  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.33 
 
 
354 aa  176  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.23 
 
 
355 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  30 
 
 
854 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.34 
 
 
358 aa  173  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0099  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  31.29 
 
 
456 aa  173  5e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.749054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  30.25 
 
 
370 aa  173  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.22 
 
 
355 aa  172  7.999999999999999e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.21 
 
 
357 aa  172  9e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  35.63 
 
 
355 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.93 
 
 
355 aa  172  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  31.75 
 
 
361 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.21 
 
 
357 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  33.91 
 
 
363 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  36.57 
 
 
358 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
361 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.1 
 
 
354 aa  170  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0205  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  32.74 
 
 
458 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0985366  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.53 
 
 
357 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  32.75 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  32.75 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  32.75 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  30.7 
 
 
370 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.17 
 
 
364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  33.53 
 
 
359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0067  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  33.11 
 
 
449 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.626782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  31.34 
 
 
357 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  32.66 
 
 
359 aa  164  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  34.22 
 
 
355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>