More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2341 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  100 
 
 
396 aa  801    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  66.67 
 
 
397 aa  568  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  52.41 
 
 
400 aa  415  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  51.26 
 
 
403 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  50.13 
 
 
400 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  50.63 
 
 
400 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  49.11 
 
 
400 aa  386  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  48.61 
 
 
399 aa  380  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  46.41 
 
 
401 aa  360  2e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  46.97 
 
 
400 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  44.3 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  46.33 
 
 
393 aa  353  4e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  45.32 
 
 
393 aa  345  7e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  47.09 
 
 
399 aa  342  9e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  42.78 
 
 
393 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  42.71 
 
 
402 aa  327  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  42.96 
 
 
402 aa  325  8.000000000000001e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  44.44 
 
 
439 aa  323  2e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  43.54 
 
 
393 aa  316  4e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  44.05 
 
 
414 aa  297  2e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  44.1 
 
 
411 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  44.1 
 
 
411 aa  294  2e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  44.1 
 
 
411 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  40 
 
 
405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  41.39 
 
 
411 aa  276  6e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  39.9 
 
 
403 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.75 
 
 
405 aa  265  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  37.76 
 
 
393 aa  262  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  37.09 
 
 
404 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.88 
 
 
393 aa  259  8e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  37.66 
 
 
393 aa  251  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  35.82 
 
 
374 aa  227  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  37 
 
 
383 aa  218  2e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  36.62 
 
 
385 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  36.78 
 
 
384 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.12 
 
 
344 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  33.98 
 
 
391 aa  209  8e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  36.89 
 
 
374 aa  209  9e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.84 
 
 
349 aa  208  1e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.98 
 
 
357 aa  208  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.93 
 
 
351 aa  207  2e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  34.75 
 
 
384 aa  206  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.69 
 
 
357 aa  206  7e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.69 
 
 
357 aa  206  8e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.97 
 
 
376 aa  204  3e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.98 
 
 
357 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.46 
 
 
355 aa  203  6e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  34.44 
 
 
391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.14 
 
 
355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.47 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  35.4 
 
 
388 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.05 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  32.31 
 
 
397 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.35 
 
 
358 aa  193  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.5 
 
 
357 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.22 
 
 
355 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.43 
 
 
356 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.29 
 
 
357 aa  191  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.79 
 
 
357 aa  189  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  35.21 
 
 
358 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  32.82 
 
 
397 aa  189  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.65 
 
 
355 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.65 
 
 
355 aa  188  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.83 
 
 
357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.42 
 
 
359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.48 
 
 
355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.33 
 
 
354 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.94 
 
 
355 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.55 
 
 
355 aa  184  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.73 
 
 
355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.66 
 
 
356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  33.52 
 
 
347 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.24 
 
 
355 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  33.07 
 
 
392 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  34.14 
 
 
355 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 
854 aa  176  6e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  33.82 
 
 
347 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.86 
 
 
358 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.16 
 
 
354 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.88 
 
 
355 aa  173  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.04 
 
 
354 aa  172  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.12 
 
 
358 aa  172  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  32.94 
 
 
828 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  32.14 
 
 
827 aa  170  4e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  32.52 
 
 
355 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  32.08 
 
 
361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.07 
 
 
356 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  33.53 
 
 
810 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  32.79 
 
 
784 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  32.79 
 
 
784 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  32.51 
 
 
784 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.51 
 
 
784 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  32.51 
 
 
784 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  30.59 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  32.51 
 
 
784 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  32.51 
 
 
784 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  31.97 
 
 
784 aa  164  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  31.97 
 
 
784 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  33.04 
 
 
361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  34.74 
 
 
359 aa  162  7e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>