More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06180 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  100 
 
 		 359 aa  700    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6337  Nucleotidyl transferase  70.11 
 
 		 359 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  70.17 
 
 		 365 aa  480  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  67.32 
 
 		 363 aa  474  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1321  nucleotidyl transferase  65.36 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.254091  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1357  nucleotidyl transferase  65.36 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00960312  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  65.36 
 
 		 359 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  64.25 
 
 		 359 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  65.08 
 
 		 359 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  67.04 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  63.64 
 
 		 370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  64.31 
 
 		 359 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0744  nucleotidyl transferase  62.05 
 
 		 364 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.196844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  62.82 
 
 		 364 aa  420  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  61.77 
 
 		 364 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  64.79 
 
 		 357 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4080  Nucleotidyl transferase  58.69 
 
 		 351 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0451  nucleotidyl transferase  61.38 
 
 		 336 aa  361  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.68714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  35.31 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  36.63 
 
 		 370 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  37.72 
 
 		 349 aa  229  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  39.62 
 
 		 366 aa  228  9e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  34.75 
 
 		 370 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  35.26 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  38.76 
 
 		 834 aa  227  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  39.3 
 
 		 367 aa  226  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  34.71 
 
 		 361 aa  225  9e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  34.71 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  40.48 
 
 		 828 aa  222  7e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  37.02 
 
 		 833 aa  222  9e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  33.69 
 
 		 835 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  37.09 
 
 		 827 aa  216  4e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  36.22 
 
 		 841 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  36.49 
 
 		 832 aa  209  7e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  32.08 
 
 		 840 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  34.97 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0738  Nucleotidyl transferase  40.57 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0293389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  33.69 
 
 		 842 aa  203  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  34.06 
 
 		 821 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  31.9 
 
 		 830 aa  203  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  35.56 
 
 		 843 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  30.43 
 
 		 841 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  36.11 
 
 		 854 aa  199  7e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  29.64 
 
 		 820 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  31.75 
 
 		 842 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  30 
 
 		 843 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  28.13 
 
 		 827 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  31.88 
 
 		 842 aa  197  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  32.01 
 
 		 832 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  35.29 
 
 		 828 aa  196  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  30.27 
 
 		 828 aa  195  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  33.61 
 
 		 833 aa  195  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.73 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  31.64 
 
 		 837 aa  193  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  34.68 
 
 		 818 aa  192  7e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  31.79 
 
 		 842 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  30.7 
 
 		 830 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  32.36 
 
 		 832 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  30.94 
 
 		 820 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  27.69 
 
 		 816 aa  189  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  31.13 
 
 		 835 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  33.14 
 
 		 347 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.66 
 
 		 836 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  30.03 
 
 		 836 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  30.19 
 
 		 828 aa  182  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  29.04 
 
 		 818 aa  181  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  29.83 
 
 		 835 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  26.72 
 
 		 776 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  28.69 
 
 		 810 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  30.05 
 
 		 835 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  28.46 
 
 		 712 aa  176  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74665  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (ATP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase) (GDP-mannose pyrophosphorylase) (CASRB1)  32.57 
 
 		 362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  29.17 
 
 		 784 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.17 
 
 		 784 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  26.63 
 
 		 392 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  29.17 
 
 		 784 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  29.44 
 
 		 785 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.65 
 
 		 784 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  30.59 
 
 		 836 aa  173  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4822  nucleotidyl transferase  33.23 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.89 
 
 		 784 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  28.89 
 
 		 784 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  31.38 
 
 		 784 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  28.89 
 
 		 784 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  31.38 
 
 		 784 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  32.74 
 
 		 346 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05586  Mannose-1-phosphate guanyltransferase (EC 2.7.7.13)(GTP-mannose-1-phosphate guanylyltransferase)(GDP-mannose pyrophosphorylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1J4]  30.33 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0561  nucleotidyl transferase  32.25 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00537127 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  27.91 
 
 		 784 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  28.65 
 
 		 836 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  25.34 
 
 		 399 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  27.7 
 
 		 392 aa  159  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  30.99 
 
 		 400 aa  159  9e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  25.34 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  27.59 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.67 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.28 
 
 		 400 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  31.45 
 
 		 388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0541  nucleotidyl transferase  33.48 
 
 		 238 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  28.01 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>