More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0954 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
354 aa  707    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.89 
 
 
356 aa  423  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.24 
 
 
355 aa  402  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.9 
 
 
357 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  58.07 
 
 
356 aa  404  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.18 
 
 
357 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.82 
 
 
355 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  54.49 
 
 
357 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.85 
 
 
364 aa  385  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  52.94 
 
 
358 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.26 
 
 
355 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.98 
 
 
355 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.96 
 
 
358 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.85 
 
 
355 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.69 
 
 
356 aa  363  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.97 
 
 
357 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.15 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.42 
 
 
355 aa  355  5e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.99 
 
 
358 aa  354  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  50.85 
 
 
355 aa  351  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.82 
 
 
357 aa  347  2e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.2 
 
 
357 aa  346  3e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.75 
 
 
355 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.42 
 
 
355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.91 
 
 
355 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.79 
 
 
376 aa  333  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  49.44 
 
 
355 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.07 
 
 
359 aa  328  7e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.53 
 
 
357 aa  322  5e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.97 
 
 
357 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.92 
 
 
354 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.39 
 
 
355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.31 
 
 
353 aa  302  7.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.82 
 
 
349 aa  296  3e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.74 
 
 
358 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.82 
 
 
355 aa  276  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.19 
 
 
344 aa  272  8.000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.71 
 
 
351 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.15 
 
 
354 aa  247  2e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  34.18 
 
 
365 aa  200  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.41 
 
 
397 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.53 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.33 
 
 
400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.78 
 
 
349 aa  176  7e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  35.33 
 
 
400 aa  176  8e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  31.28 
 
 
330 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  32.54 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.33 
 
 
400 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  32.74 
 
 
392 aa  172  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  32.15 
 
 
405 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0048  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.66 
 
 
294 aa  169  5e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.231271  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  33.8 
 
 
330 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 
296 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0511  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.89 
 
 
290 aa  165  9e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
298 aa  165  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0639  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.86 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.477683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  30.87 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  36.07 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.18 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  30.83 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  38.02 
 
 
243 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03410  Glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.66 
 
 
293 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0401967  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
292 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0257  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.99 
 
 
290 aa  163  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00751655  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  31.94 
 
 
411 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  33.52 
 
 
402 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.08 
 
 
296 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
296 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1570  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.3 
 
 
294 aa  162  9e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  31.44 
 
 
387 aa  162  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1540  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.3 
 
 
294 aa  162  9e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.86 
 
 
295 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.17 
 
 
290 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00952178  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  32.23 
 
 
411 aa  161  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.41 
 
 
286 aa  162  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0390  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.44 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.86 
 
 
288 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0872  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.44 
 
 
297 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.29 
 
 
295 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
312 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  30.66 
 
 
326 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3841  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.02 
 
 
290 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3848  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.86 
 
 
296 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4076  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.86 
 
 
296 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0532179  normal  0.23652 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0843  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.44 
 
 
297 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0237145 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.39 
 
 
294 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911631  normal  0.057049 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.13 
 
 
292 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  37.5 
 
 
292 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  28.57 
 
 
392 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  31.64 
 
 
411 aa  160  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
291 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.71 
 
 
293 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.01 
 
 
245 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0166  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
293 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4290  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.71 
 
 
290 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.314543 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.67 
 
 
320 aa  159  5e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.01 
 
 
245 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.89 
 
 
292 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.180776  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
292 aa  159  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>