More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2508 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 		 344 aa  681    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.04 
 
 		 357 aa  309  5.9999999999999995e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.9 
 
 		 376 aa  295  6e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.76 
 
 		 355 aa  295  9e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.21 
 
 		 356 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.32 
 
 		 355 aa  294  1e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.18 
 
 		 356 aa  293  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.03 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.63 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  45.92 
 
 		 355 aa  289  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.47 
 
 		 355 aa  289  6e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.2 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.92 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  46.18 
 
 		 355 aa  285  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.76 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.87 
 
 		 356 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.2 
 
 		 355 aa  281  9e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.7 
 
 		 357 aa  280  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.1 
 
 		 359 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.36 
 
 		 358 aa  279  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.98 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.05 
 
 		 355 aa  275  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.6 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.34 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.19 
 
 		 354 aa  272  7e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.59 
 
 		 355 aa  270  2e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.63 
 
 		 357 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.63 
 
 		 357 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.07 
 
 		 357 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.37 
 
 		 357 aa  262  4.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.15 
 
 		 364 aa  262  6e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.9 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.13 
 
 		 349 aa  257  2e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  41.97 
 
 		 358 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.66 
 
 		 357 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.19 
 
 		 355 aa  252  8.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.53 
 
 		 355 aa  250  3e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.62 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.88 
 
 		 354 aa  238  9e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.12 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  39.12 
 
 		 396 aa  211  2e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  38.64 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  39.82 
 
 		 411 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  36.47 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.2 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.58 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  36.98 
 
 		 400 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.39 
 
 		 400 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  39.52 
 
 		 411 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  31.41 
 
 		 365 aa  193  4e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.03 
 
 		 353 aa  192  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  38.62 
 
 		 411 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  37.86 
 
 		 414 aa  188  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.5 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  32.94 
 
 		 399 aa  178  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  37.57 
 
 		 411 aa  176  5e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  32.48 
 
 		 325 aa  176  7e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  35.52 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  34.33 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  33.23 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  35.82 
 
 		 400 aa  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  32.83 
 
 		 325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  36.42 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  38.62 
 
 		 245 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1181  nucleotidyl transferase  36.73 
 
 		 246 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0563368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.62 
 
 		 245 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.62 
 
 		 245 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  34.71 
 
 		 399 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.62 
 
 		 245 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.02 
 
 		 245 aa  162  9e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  32.54 
 
 		 325 aa  162  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.21 
 
 		 245 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.62 
 
 		 245 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  32.02 
 
 		 325 aa  160  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.4 
 
 		 245 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  37.76 
 
 		 244 aa  160  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.4 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.27 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  37.8 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  33.82 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2033  Nucleotidyl transferase  32.22 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  32.02 
 
 		 392 aa  155  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  31.55 
 
 		 827 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0937  nucleotidyl transferase  34.96 
 
 		 257 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  37.61 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2406  Nucleotidyl transferase  38.16 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  36.89 
 
 		 385 aa  154  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4084  nucleotidyl transferase  30.26 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.313929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0881  nucleotidyl transferase  29.68 
 
 		 331 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.68 
 
 		 240 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.88 
 
 		 325 aa  152  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  40 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  36.64 
 
 		 253 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  32.65 
 
 		 393 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1221  nucleotidyl transferase  31.41 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  29.06 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  36.02 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  30.23 
 
 		 784 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  32.65 
 
 		 393 aa  149  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  30.23 
 
 		 784 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>