More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0258 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 		 356 aa  702    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  67.13 
 
 		 356 aa  476  1e-133  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  63.28 
 
 		 355 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.18 
 
 		 355 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.89 
 
 		 354 aa  423  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  59.1 
 
 		 357 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  57.14 
 
 		 357 aa  401  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  57.14 
 
 		 357 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  55.99 
 
 		 358 aa  390  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  55.18 
 
 		 357 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.75 
 
 		 364 aa  384  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.22 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.83 
 
 		 358 aa  357  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.82 
 
 		 355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.55 
 
 		 355 aa  354  2e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.42 
 
 		 355 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.82 
 
 		 357 aa  340  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.16 
 
 		 376 aa  339  4e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.17 
 
 		 355 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.28 
 
 		 356 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.56 
 
 		 355 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.61 
 
 		 355 aa  335  5.999999999999999e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.46 
 
 		 355 aa  332  5e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.16 
 
 		 358 aa  332  8e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.46 
 
 		 359 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.9 
 
 		 355 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  48.88 
 
 		 355 aa  324  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  47.19 
 
 		 355 aa  312  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.48 
 
 		 355 aa  311  1e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.4 
 
 		 349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.78 
 
 		 354 aa  303  4.0000000000000003e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.46 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.41 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.33 
 
 		 355 aa  294  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.71 
 
 		 357 aa  292  5e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.87 
 
 		 344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.83 
 
 		 354 aa  273  4.0000000000000004e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.54 
 
 		 353 aa  272  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.32 
 
 		 351 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.71 
 
 		 397 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  34.18 
 
 		 365 aa  197  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.62 
 
 		 405 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  34.66 
 
 		 396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.44 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  33.53 
 
 		 405 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  37.01 
 
 		 400 aa  176  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  40.6 
 
 		 243 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.24 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.48 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  34.55 
 
 		 403 aa  170  3e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  39.42 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  32.11 
 
 		 411 aa  169  6e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 		 292 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.93 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7294  Nucleotidyl transferase  31.86 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  40.68 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  31.09 
 
 		 411 aa  166  4e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  31.09 
 
 		 411 aa  165  9e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  32.6 
 
 		 330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  30.25 
 
 		 411 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  37.98 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  36.05 
 
 		 253 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  35.8 
 
 		 400 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  38.63 
 
 		 253 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.31 
 
 		 294 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  37.99 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.08 
 
 		 286 aa  162  6e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.73 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0303  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.41 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3810  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.5 
 
 		 292 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.24 
 
 		 295 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.29 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  37.07 
 
 		 257 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.39 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  32.79 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1786  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 		 292 aa  159  6e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0200  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 		 289 aa  159  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.310491  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  32.34 
 
 		 402 aa  159  6e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.49 
 
 		 349 aa  159  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.75 
 
 		 293 aa  159  8e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.24 
 
 		 296 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0919  Nucleotidyl transferase  37.85 
 
 		 245 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527994  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2406  Nucleotidyl transferase  39.57 
 
 		 239 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  37.82 
 
 		 292 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 		 294 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  38.3 
 
 		 244 aa  158  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0233159  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2862  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 		 301 aa  158  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105024  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3859  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.44 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 		 296 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  36.09 
 
 		 383 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  31.58 
 
 		 325 aa  157  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.82 
 
 		 296 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1783  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.71 
 
 		 293 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  29.92 
 
 		 414 aa  157  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.82 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.66 
 
 		 296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3118  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.71 
 
 		 290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.34 
 
 		 293 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>