More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1383 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
355 aa  723    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  61.13 
 
 
355 aa  448  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.18 
 
 
356 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.9 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  53.82 
 
 
354 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  54.78 
 
 
357 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.25 
 
 
357 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  52.25 
 
 
357 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.31 
 
 
357 aa  363  2e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.84 
 
 
376 aa  362  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  51.4 
 
 
357 aa  358  7e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.16 
 
 
355 aa  358  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  51.26 
 
 
358 aa  358  8e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.31 
 
 
355 aa  357  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.86 
 
 
364 aa  356  3.9999999999999996e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.16 
 
 
355 aa  354  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.73 
 
 
355 aa  354  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  49.01 
 
 
355 aa  354  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.75 
 
 
358 aa  347  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.77 
 
 
359 aa  344  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.91 
 
 
355 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.32 
 
 
356 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.45 
 
 
355 aa  333  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  47.61 
 
 
355 aa  332  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.2 
 
 
358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.94 
 
 
357 aa  325  6e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  46.91 
 
 
355 aa  318  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.7 
 
 
355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.46 
 
 
357 aa  308  8e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.69 
 
 
358 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.34 
 
 
357 aa  306  5.0000000000000004e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.76 
 
 
344 aa  295  9e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.42 
 
 
354 aa  289  4e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.69 
 
 
349 aa  288  9e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.83 
 
 
355 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.34 
 
 
354 aa  275  7e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.97 
 
 
353 aa  268  1e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.73 
 
 
355 aa  264  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.73 
 
 
351 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.24 
 
 
397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.64 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  35.05 
 
 
396 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  35.37 
 
 
400 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.57 
 
 
400 aa  192  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  35.42 
 
 
411 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  35.42 
 
 
411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  29.78 
 
 
365 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  32.21 
 
 
405 aa  177  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  35.12 
 
 
411 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.86 
 
 
405 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1402  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.66 
 
 
291 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00196644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  33.72 
 
 
399 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  32.92 
 
 
392 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  33.53 
 
 
392 aa  171  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1319  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.59 
 
 
291 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0322301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  38.56 
 
 
235 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  32.96 
 
 
400 aa  168  1e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.55 
 
 
320 aa  168  1e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0305  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.5 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2733  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.66 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1798  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.4 
 
 
287 aa  166  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2629  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.29 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.357597  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  33.54 
 
 
403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  32.88 
 
 
414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1399  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.82 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0714  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.4 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  32.6 
 
 
392 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.98 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3121  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.4 
 
 
293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0504  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.56 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0219924  normal  0.028839 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1753  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
301 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2662  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
289 aa  163  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.29 
 
 
245 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0257  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.71 
 
 
290 aa  164  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00751655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.34 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.44 
 
 
291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4180  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.97 
 
 
293 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.112992  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0924  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, long form  37.71 
 
 
293 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.15 
 
 
240 aa  162  6e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2032  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.66 
 
 
312 aa  162  6e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1619  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.08 
 
 
295 aa  162  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.02 
 
 
286 aa  162  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1449  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
291 aa  162  8.000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.97 
 
 
293 aa  162  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2558  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
295 aa  162  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2539  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.56 
 
 
289 aa  162  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1783  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.86 
 
 
293 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30 
 
 
353 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0684  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase protein  39.08 
 
 
292 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1473  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.66 
 
 
287 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.905305  normal  0.376761 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0621  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  36.97 
 
 
293 aa  161  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3286  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
288 aa  161  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3019  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  35.98 
 
 
295 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.313086  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2829  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.86 
 
 
289 aa  162  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0574416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2862  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.97 
 
 
301 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000105024  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.44 
 
 
245 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0179  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase RmlA  36.4 
 
 
294 aa  161  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1069  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.57 
 
 
296 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.69912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.86 
 
 
245 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0478  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.13 
 
 
293 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.543511  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>