More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0747 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  100 
 
 
359 aa  712    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  65.18 
 
 
376 aa  489  1e-137  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  62.64 
 
 
355 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  61.8 
 
 
355 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  56.82 
 
 
357 aa  422  1e-117  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.47 
 
 
357 aa  358  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  50.28 
 
 
355 aa  352  8e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.19 
 
 
357 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  48.19 
 
 
357 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.99 
 
 
364 aa  346  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.77 
 
 
355 aa  344  1e-93  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.85 
 
 
355 aa  344  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.13 
 
 
355 aa  343  2e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  47.22 
 
 
357 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.07 
 
 
355 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.13 
 
 
355 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5901  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.13 
 
 
356 aa  332  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  46.11 
 
 
358 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.07 
 
 
354 aa  328  7e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  46.46 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.44 
 
 
358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  45.13 
 
 
355 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  44.41 
 
 
355 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0713  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.85 
 
 
358 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.974379 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.85 
 
 
356 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.57 
 
 
355 aa  312  4.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  43.02 
 
 
355 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.55 
 
 
357 aa  308  6.999999999999999e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  44.13 
 
 
354 aa  306  5.0000000000000004e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.33 
 
 
357 aa  305  9.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.97 
 
 
357 aa  296  3e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.18 
 
 
358 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  41.11 
 
 
355 aa  290  2e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2096  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.83 
 
 
353 aa  281  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.1 
 
 
344 aa  280  3e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  42.06 
 
 
349 aa  273  2.0000000000000002e-72  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  39.78 
 
 
355 aa  273  3e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  43.3 
 
 
351 aa  265  8e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  40.11 
 
 
354 aa  257  2e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1115  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.53 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1267  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.43 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4074  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.43 
 
 
245 aa  197  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1373  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.49 
 
 
245 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1135  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.04 
 
 
245 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1228  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.04 
 
 
245 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, putative  41.04 
 
 
245 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.161343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0054  Nucleotidyl transferase  42.8 
 
 
243 aa  195  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1475  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.52 
 
 
353 aa  195  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000811226  normal  0.134994 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1296  putative glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  41.04 
 
 
245 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103191 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.2 
 
 
397 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1109  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.64 
 
 
245 aa  193  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1122  nucleotidyl transferase  40.24 
 
 
245 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.236297  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  36.87 
 
 
400 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0192  nucleotidyl transferase  30.17 
 
 
365 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.415123 
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  35.69 
 
 
400 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4141  Nucleotidyl transferase  39.42 
 
 
253 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000020886 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  36.42 
 
 
396 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1351  Nucleotidyl transferase  38.34 
 
 
257 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0937  nucleotidyl transferase  39.41 
 
 
257 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  37.43 
 
 
411 aa  182  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0188  nucleotidyl transferase  40.52 
 
 
244 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
400 aa  180  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2763  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.34 
 
 
300 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.010329  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0479  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.55 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000000331909  decreased coverage  0.00000000439199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0233  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.43 
 
 
240 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00581179  normal  0.550087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2377  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.08 
 
 
299 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.217402  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  35.01 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1570  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.15 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1540  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.15 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2230  nucleotidyl transferase  39.66 
 
 
235 aa  172  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2458  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.66 
 
 
291 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  36.76 
 
 
411 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0511  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.55 
 
 
290 aa  170  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  36.18 
 
 
411 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2406  Nucleotidyl transferase  37.29 
 
 
239 aa  170  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0838  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.27 
 
 
293 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22071  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6654  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40 
 
 
292 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147178  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1423  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.81 
 
 
291 aa  169  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2342  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.55 
 
 
292 aa  169  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1238  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.5 
 
 
296 aa  169  8e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.981269 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1382  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.66 
 
 
293 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000585484 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4130  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.26 
 
 
294 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.85 
 
 
289 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1224  glucose-1-phosphate thymidyl transferase  39.66 
 
 
289 aa  168  1e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  32.2 
 
 
325 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3681  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.88 
 
 
293 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0233159  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3038  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.75 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2395  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.66 
 
 
296 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  36.76 
 
 
411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4001  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.24 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2672  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.24 
 
 
296 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00250825  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13103  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.42 
 
 
286 aa  167  4e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1277  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  37.92 
 
 
296 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.85 
 
 
296 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
405 aa  166  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2335  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  38.02 
 
 
307 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5509  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.22 
 
 
296 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  32.38 
 
 
325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01934  hypothetical protein  39.24 
 
 
270 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  34.85 
 
 
296 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>