More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2344 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  100 
 
 
405 aa  816    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  60 
 
 
405 aa  502  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.33 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  44.62 
 
 
374 aa  318  7.999999999999999e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  41.83 
 
 
393 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  41.83 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  41.46 
 
 
400 aa  298  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  40.59 
 
 
400 aa  295  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  40.1 
 
 
400 aa  293  3e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  40 
 
 
396 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  39.65 
 
 
397 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  40.25 
 
 
385 aa  263  4e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  34.24 
 
 
399 aa  256  5e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  37.08 
 
 
400 aa  252  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  35.22 
 
 
399 aa  251  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  36.34 
 
 
403 aa  251  2e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  36.21 
 
 
401 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  37.22 
 
 
400 aa  241  1e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  39.07 
 
 
383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  36.21 
 
 
384 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  36.21 
 
 
374 aa  225  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  35.71 
 
 
384 aa  223  7e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  34.07 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  33.08 
 
 
397 aa  220  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  33.66 
 
 
402 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  33.58 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  32.93 
 
 
391 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  34.3 
 
 
411 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  31.47 
 
 
397 aa  209  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  32.53 
 
 
391 aa  209  7e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  35.02 
 
 
411 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  34.94 
 
 
388 aa  208  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  35.73 
 
 
403 aa  207  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  34.54 
 
 
411 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  32.19 
 
 
393 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  30.77 
 
 
393 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.64 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  32.06 
 
 
387 aa  199  7e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  32.85 
 
 
414 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  29.57 
 
 
392 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  30.39 
 
 
393 aa  190  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  37.2 
 
 
376 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.74 
 
 
349 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  31.27 
 
 
357 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  30.1 
 
 
841 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  31.44 
 
 
840 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  29.63 
 
 
842 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.63 
 
 
357 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  29.78 
 
 
393 aa  180  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.06 
 
 
357 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.53 
 
 
356 aa  177  3e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  30.64 
 
 
842 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1383  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.21 
 
 
355 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  28.33 
 
 
833 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  30.69 
 
 
818 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  29.95 
 
 
842 aa  176  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  31.96 
 
 
411 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  30.94 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  31.06 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  30.3 
 
 
439 aa  173  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.53 
 
 
355 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  30.22 
 
 
843 aa  172  6.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  29.03 
 
 
830 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.15 
 
 
354 aa  171  2e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.63 
 
 
356 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  29.58 
 
 
399 aa  170  5e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1488  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.24 
 
 
357 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000150762 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0480  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.89 
 
 
357 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.85 
 
 
355 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0493  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.89 
 
 
357 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.79936  normal  0.265363 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  30.27 
 
 
820 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.51 
 
 
351 aa  167  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  27.63 
 
 
854 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0747  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.43 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.04 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1537  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.04 
 
 
364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.307864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2860  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.82 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.82 
 
 
355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3356  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase, short form  34.12 
 
 
358 aa  164  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.971675  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  32.74 
 
 
355 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.36 
 
 
355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  31.7 
 
 
827 aa  163  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29 
 
 
784 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  29 
 
 
784 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29 
 
 
784 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  28.99 
 
 
830 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  32.75 
 
 
347 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  29.93 
 
 
392 aa  161  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  29 
 
 
784 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.84 
 
 
355 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  29 
 
 
784 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0413  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.65 
 
 
355 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0183855  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4297  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.5 
 
 
357 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03020  mannose-1-phosphate guanylyltransferase, putative  31.42 
 
 
364 aa  159  8e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  30.69 
 
 
835 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  27.76 
 
 
837 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  28.75 
 
 
784 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  28.75 
 
 
784 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  29.32 
 
 
784 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  26.6 
 
 
833 aa  157  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>