More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0498 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  52.47 
 
 
842 aa  904    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  100 
 
 
837 aa  1701    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  52.69 
 
 
840 aa  928    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  52.59 
 
 
842 aa  907    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  51.26 
 
 
843 aa  899    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  52.47 
 
 
841 aa  929    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  53.61 
 
 
842 aa  917    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  35.92 
 
 
827 aa  604  1.0000000000000001e-171  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  35.71 
 
 
835 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  35.92 
 
 
816 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  34.52 
 
 
835 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  37.04 
 
 
832 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  37.29 
 
 
832 aa  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  37.62 
 
 
841 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  36.18 
 
 
832 aa  562  1e-158  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  37.14 
 
 
827 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  35.12 
 
 
820 aa  560  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.26 
 
 
828 aa  559  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  37.55 
 
 
835 aa  558  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  34.4 
 
 
836 aa  552  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  34.13 
 
 
835 aa  551  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  36.4 
 
 
830 aa  550  1e-155  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  37.02 
 
 
834 aa  548  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  34.12 
 
 
836 aa  549  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  37.2 
 
 
843 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  36.52 
 
 
828 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  33.89 
 
 
836 aa  543  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  33.25 
 
 
810 aa  543  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  33.65 
 
 
836 aa  538  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  34.98 
 
 
833 aa  536  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.11 
 
 
842 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  36.13 
 
 
830 aa  533  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  36.29 
 
 
818 aa  529  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  35 
 
 
828 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  33.45 
 
 
818 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  31.15 
 
 
828 aa  488  1e-136  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  32.74 
 
 
820 aa  476  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  34.53 
 
 
821 aa  473  1e-132  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  31.18 
 
 
776 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  34.2 
 
 
833 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  31.81 
 
 
854 aa  436  1e-121  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  36.68 
 
 
712 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  26.52 
 
 
784 aa  362  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.4 
 
 
784 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.64 
 
 
784 aa  358  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  26.28 
 
 
784 aa  355  2e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  26.28 
 
 
784 aa  355  2e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  26.94 
 
 
784 aa  353  5e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  26.82 
 
 
784 aa  353  7e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  26.16 
 
 
784 aa  353  7e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  25.81 
 
 
784 aa  349  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  25.69 
 
 
784 aa  348  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  29.97 
 
 
785 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.86 
 
 
343 aa  250  7e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  33.51 
 
 
399 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  35.5 
 
 
370 aa  244  5e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  34.29 
 
 
392 aa  241  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  34.11 
 
 
370 aa  240  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  36.73 
 
 
361 aa  238  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  38.42 
 
 
346 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 
347 aa  235  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  36.44 
 
 
361 aa  235  3e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  36.15 
 
 
361 aa  234  5e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  34.9 
 
 
370 aa  232  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  38.39 
 
 
347 aa  231  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  40 
 
 
329 aa  231  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.19 
 
 
349 aa  223  9e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  30.47 
 
 
392 aa  219  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  32.09 
 
 
387 aa  216  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.73 
 
 
348 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  32.42 
 
 
387 aa  213  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  34.08 
 
 
381 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.08 
 
 
389 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  31.77 
 
 
387 aa  206  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  31.13 
 
 
392 aa  204  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.13 
 
 
392 aa  203  8e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  32.96 
 
 
388 aa  201  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.25 
 
 
392 aa  200  7.999999999999999e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.64 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.04 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.64 
 
 
392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  32.58 
 
 
388 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  33.88 
 
 
367 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.53 
 
 
392 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  32.58 
 
 
388 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  32.96 
 
 
389 aa  198  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.04 
 
 
392 aa  198  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  34.58 
 
 
366 aa  197  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  32.68 
 
 
389 aa  197  9e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
392 aa  196  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.13 
 
 
392 aa  196  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.73 
 
 
392 aa  196  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  32.02 
 
 
388 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  31.45 
 
 
359 aa  193  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  33.89 
 
 
357 aa  193  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  32.32 
 
 
364 aa  191  7e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  31.08 
 
 
363 aa  190  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  32.61 
 
 
359 aa  187  7e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0737  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
357 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.879816 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  30.16 
 
 
388 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>