More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1463 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  86.68 
 
 		 843 aa  1412    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  37.95 
 
 		 827 aa  659    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  69.25 
 
 		 832 aa  1167    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  68.64 
 
 		 834 aa  1127    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  69.98 
 
 		 828 aa  1168    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  100 
 
 		 828 aa  1630    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  69.41 
 
 		 833 aa  1152    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  72.03 
 
 		 827 aa  1194    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  68.2 
 
 		 841 aa  1145    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  39.1 
 
 		 842 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  39.76 
 
 		 830 aa  624  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  38.86 
 
 		 842 aa  624  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.38 
 
 		 842 aa  620  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  39.47 
 
 		 835 aa  610  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  38.96 
 
 		 832 aa  605  9.999999999999999e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  37.39 
 
 		 841 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  38.01 
 
 		 840 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  39.45 
 
 		 832 aa  603  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  37.53 
 
 		 843 aa  604  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  40.72 
 
 		 833 aa  592  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  39.54 
 
 		 818 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.26 
 
 		 836 aa  571  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  36.78 
 
 		 836 aa  567  1e-160  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  34.18 
 
 		 816 aa  564  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  35.81 
 
 		 836 aa  561  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  35.98 
 
 		 835 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 		 835 aa  553  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  36.56 
 
 		 828 aa  554  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  36.33 
 
 		 835 aa  551  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  35.81 
 
 		 836 aa  550  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  35.54 
 
 		 830 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  34.67 
 
 		 820 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.66 
 
 		 842 aa  536  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.52 
 
 		 837 aa  535  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  35.18 
 
 		 818 aa  529  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  31.48 
 
 		 810 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  32.69 
 
 		 828 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  35.19 
 
 		 820 aa  498  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  36.73 
 
 		 854 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  36.8 
 
 		 821 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  28.99 
 
 		 776 aa  415  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.66 
 
 		 784 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.66 
 
 		 784 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  28.88 
 
 		 784 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.29 
 
 		 784 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  28.88 
 
 		 784 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  28.04 
 
 		 784 aa  399  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  28.04 
 
 		 784 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.54 
 
 		 784 aa  398  1e-109  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.41 
 
 		 784 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  28 
 
 		 784 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  32.3 
 
 		 785 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  30.4 
 
 		 712 aa  361  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  38.59 
 
 		 370 aa  280  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  38.87 
 
 		 370 aa  276  9e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  35.11 
 
 		 399 aa  265  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  41.67 
 
 		 346 aa  261  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  35.11 
 
 		 392 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  39.71 
 
 		 343 aa  259  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  39.56 
 
 		 347 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  34.26 
 
 		 370 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  40.93 
 
 		 366 aa  251  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.61 
 
 		 389 aa  247  8e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  37.94 
 
 		 361 aa  244  5e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  37.94 
 
 		 361 aa  244  6e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  38.24 
 
 		 361 aa  243  9e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  38.18 
 
 		 388 aa  243  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  36.93 
 
 		 388 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  37.04 
 
 		 381 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  33.59 
 
 		 392 aa  241  5e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  36.93 
 
 		 388 aa  240  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  36.93 
 
 		 388 aa  240  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  36.2 
 
 		 347 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  34.9 
 
 		 348 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  32.45 
 
 		 392 aa  235  3e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  33.33 
 
 		 387 aa  234  6e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 392 aa  233  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 392 aa  233  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  35.8 
 
 		 389 aa  233  9e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.5 
 
 		 392 aa  230  6e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  34.66 
 
 		 389 aa  229  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  31.91 
 
 		 387 aa  229  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.92 
 
 		 392 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.92 
 
 		 392 aa  227  6e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  38.34 
 
 		 329 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.05 
 
 		 392 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.92 
 
 		 392 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.05 
 
 		 392 aa  225  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  33.63 
 
 		 387 aa  224  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.69 
 
 		 392 aa  223  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.76 
 
 		 392 aa  222  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  36.31 
 
 		 367 aa  221  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.94 
 
 		 349 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  38.51 
 
 		 363 aa  213  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  35.41 
 
 		 370 aa  207  7e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0712  nucleotidyl transferase  35.56 
 
 		 376 aa  204  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.68 
 
 		 364 aa  201  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  38.16 
 
 		 364 aa  201  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0300  nucleotidyl transferase  32.18 
 
 		 397 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  35.45 
 
 		 359 aa  197  9e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.580301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>