More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5002 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  68.95 
 
 
834 aa  1132    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  68.83 
 
 
832 aa  1169    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  67.91 
 
 
833 aa  1142    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  72.31 
 
 
827 aa  1196    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  86.68 
 
 
828 aa  1432    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  70.1 
 
 
828 aa  1166    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  100 
 
 
843 aa  1664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  38.27 
 
 
827 aa  671    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  40.19 
 
 
830 aa  636    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  68.31 
 
 
841 aa  1161    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.98 
 
 
842 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  38.2 
 
 
842 aa  623  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  38.63 
 
 
842 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  39.86 
 
 
832 aa  618  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  39.14 
 
 
832 aa  619  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  39.11 
 
 
835 aa  614  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  36.69 
 
 
843 aa  608  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  37.73 
 
 
841 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  37.05 
 
 
840 aa  600  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.35 
 
 
836 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  39.54 
 
 
818 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.41 
 
 
836 aa  582  1e-164  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  37.05 
 
 
836 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  40.56 
 
 
833 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  37.29 
 
 
835 aa  570  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  36.61 
 
 
835 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  36.94 
 
 
836 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  36.52 
 
 
830 aa  559  1e-158  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  36.29 
 
 
828 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  34.03 
 
 
816 aa  551  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  36.14 
 
 
835 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.05 
 
 
842 aa  549  1e-154  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.2 
 
 
837 aa  548  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  33.9 
 
 
820 aa  538  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  34.79 
 
 
818 aa  524  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  30.78 
 
 
810 aa  513  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  32.57 
 
 
828 aa  508  9.999999999999999e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  36.06 
 
 
854 aa  498  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  34.34 
 
 
820 aa  485  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
821 aa  463  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  29.55 
 
 
776 aa  425  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.1 
 
 
784 aa  409  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  27.98 
 
 
784 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  27.98 
 
 
784 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.1 
 
 
784 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  27.61 
 
 
784 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  27.73 
 
 
784 aa  403  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  27.73 
 
 
784 aa  405  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  27.98 
 
 
784 aa  405  1e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  27.85 
 
 
784 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  27.82 
 
 
784 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  27.45 
 
 
785 aa  384  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  34.94 
 
 
712 aa  367  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  38.89 
 
 
370 aa  280  1e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  38.61 
 
 
370 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  36.22 
 
 
399 aa  272  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  35.43 
 
 
392 aa  265  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  41.64 
 
 
346 aa  262  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  39.71 
 
 
343 aa  260  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  35.16 
 
 
370 aa  256  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  38.57 
 
 
347 aa  255  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  40.65 
 
 
366 aa  251  3e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.08 
 
 
389 aa  249  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  38.44 
 
 
361 aa  248  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  37.36 
 
 
381 aa  247  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  33.93 
 
 
392 aa  247  6e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  38.15 
 
 
361 aa  246  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  37.92 
 
 
388 aa  246  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  38.44 
 
 
361 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  36.41 
 
 
388 aa  244  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.29 
 
 
392 aa  243  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  35.67 
 
 
347 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38 
 
 
392 aa  239  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  32.55 
 
 
392 aa  238  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  35.85 
 
 
388 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  35.85 
 
 
388 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  34.29 
 
 
348 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
392 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  39.62 
 
 
329 aa  234  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  35.57 
 
 
389 aa  234  4.0000000000000004e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
392 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.96 
 
 
392 aa  234  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  32.98 
 
 
387 aa  234  7.000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.68 
 
 
392 aa  233  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  34.73 
 
 
389 aa  232  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.1 
 
 
392 aa  230  7e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  33.85 
 
 
387 aa  230  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.24 
 
 
392 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.83 
 
 
392 aa  226  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  33.63 
 
 
387 aa  224  6e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.96 
 
 
392 aa  223  9e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  34.72 
 
 
349 aa  219  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  36.63 
 
 
363 aa  217  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  36.87 
 
 
370 aa  213  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  34.16 
 
 
367 aa  212  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  38.1 
 
 
364 aa  207  8e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  36.69 
 
 
359 aa  204  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1729  nucleotidyl transferase  36.54 
 
 
359 aa  204  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.442987  normal  0.868818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.87 
 
 
364 aa  203  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1338  nucleotidyl transferase  36.83 
 
 
359 aa  201  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>