More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1394 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  68.83 
 
 
843 aa  1154    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  41.45 
 
 
832 aa  671    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  100 
 
 
832 aa  1671    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  40.6 
 
 
832 aa  671    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  37.08 
 
 
827 aa  650    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  77.58 
 
 
828 aa  1319    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  76.56 
 
 
834 aa  1295    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  69.25 
 
 
828 aa  1167    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  78.91 
 
 
827 aa  1339    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  42.27 
 
 
830 aa  689    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  69.23 
 
 
841 aa  1208    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  41.11 
 
 
835 aa  662    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  82.47 
 
 
833 aa  1394    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  38.85 
 
 
842 aa  630  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  37.79 
 
 
841 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  37.35 
 
 
842 aa  622  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  37.47 
 
 
842 aa  619  1e-176  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  36.94 
 
 
840 aa  616  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.44 
 
 
836 aa  609  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.73 
 
 
836 aa  611  1e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  37.06 
 
 
843 aa  607  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  38.08 
 
 
835 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  36.78 
 
 
835 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  35.92 
 
 
816 aa  591  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  37.11 
 
 
836 aa  588  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  39 
 
 
818 aa  588  1e-166  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  37 
 
 
820 aa  586  1e-166  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  36.96 
 
 
830 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  39.35 
 
 
833 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  37.4 
 
 
835 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  38.19 
 
 
842 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  36.63 
 
 
836 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  36.55 
 
 
828 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  36.45 
 
 
818 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.18 
 
 
837 aa  558  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  32.93 
 
 
810 aa  550  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  36.02 
 
 
820 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  33.98 
 
 
828 aa  533  1e-150  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  36.57 
 
 
854 aa  527  1e-148  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  37.45 
 
 
821 aa  469  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  30.62 
 
 
776 aa  435  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.96 
 
 
784 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.71 
 
 
784 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  28.59 
 
 
784 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.84 
 
 
784 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.84 
 
 
784 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.46 
 
 
784 aa  396  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  28.46 
 
 
784 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  28.34 
 
 
784 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  28.34 
 
 
784 aa  395  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  28.84 
 
 
785 aa  387  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  27.97 
 
 
784 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  30.98 
 
 
712 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  40.56 
 
 
370 aa  299  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  40.83 
 
 
370 aa  294  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  35.43 
 
 
399 aa  276  9e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  37.01 
 
 
392 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  37.67 
 
 
370 aa  269  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  33.86 
 
 
392 aa  262  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  33.76 
 
 
392 aa  262  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  41.94 
 
 
346 aa  261  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  37.64 
 
 
361 aa  255  3e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  37.69 
 
 
361 aa  252  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  40.11 
 
 
366 aa  249  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  33.86 
 
 
387 aa  248  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  36.78 
 
 
361 aa  248  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.97 
 
 
343 aa  248  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.29 
 
 
389 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.22 
 
 
392 aa  243  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  34.77 
 
 
347 aa  242  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.82 
 
 
392 aa  240  6.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  38.46 
 
 
349 aa  239  1e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  37.29 
 
 
381 aa  239  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.54 
 
 
392 aa  238  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  33.59 
 
 
387 aa  238  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  37.57 
 
 
388 aa  237  8e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  39.14 
 
 
329 aa  237  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.96 
 
 
392 aa  236  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  36.29 
 
 
388 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  31.13 
 
 
387 aa  233  1e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  34.81 
 
 
347 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  36.34 
 
 
389 aa  231  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.72 
 
 
392 aa  231  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35 
 
 
392 aa  231  5e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35 
 
 
392 aa  230  9e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  33.15 
 
 
348 aa  230  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35 
 
 
392 aa  230  9e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  37.19 
 
 
367 aa  229  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
392 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  35.28 
 
 
392 aa  227  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  34.97 
 
 
388 aa  227  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  34.97 
 
 
388 aa  227  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  35.33 
 
 
389 aa  226  1e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  37.17 
 
 
370 aa  217  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  36.21 
 
 
363 aa  211  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  36.49 
 
 
359 aa  209  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  34.73 
 
 
364 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  35.51 
 
 
359 aa  207  7e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1374  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.67 
 
 
364 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  33.42 
 
 
359 aa  201  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>