More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2958 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  55.86 
 
 
836 aa  994    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  55.89 
 
 
835 aa  995    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  56.21 
 
 
836 aa  1001    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  55.86 
 
 
836 aa  979    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  54.43 
 
 
835 aa  967    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  100 
 
 
842 aa  1728    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  55.08 
 
 
836 aa  983    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  42.57 
 
 
828 aa  715    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  55.62 
 
 
835 aa  973    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  38.2 
 
 
827 aa  613  9.999999999999999e-175  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  39.19 
 
 
842 aa  608  9.999999999999999e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.83 
 
 
842 aa  602  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  39.38 
 
 
832 aa  601  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  38.57 
 
 
840 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  39.62 
 
 
832 aa  598  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  38.23 
 
 
841 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  38.16 
 
 
835 aa  587  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  38.3 
 
 
830 aa  586  1e-166  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  38.02 
 
 
842 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  37.28 
 
 
843 aa  584  1.0000000000000001e-165  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  38.66 
 
 
833 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  38.19 
 
 
832 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  36.61 
 
 
827 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.7 
 
 
828 aa  550  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  37.28 
 
 
834 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  36.66 
 
 
828 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  37.05 
 
 
843 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  33.81 
 
 
816 aa  531  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  35.88 
 
 
841 aa  526  1e-148  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  35.11 
 
 
837 aa  525  1e-147  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  34.3 
 
 
820 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  32.1 
 
 
810 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  35.13 
 
 
828 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  35.09 
 
 
830 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  35.93 
 
 
833 aa  496  1e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  36.01 
 
 
818 aa  493  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  34.25 
 
 
820 aa  492  1e-137  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  32.74 
 
 
818 aa  466  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  35.13 
 
 
821 aa  449  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  31.89 
 
 
776 aa  437  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  29.87 
 
 
854 aa  414  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  27.03 
 
 
784 aa  350  4e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  27.24 
 
 
784 aa  350  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  31.4 
 
 
712 aa  349  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  26.9 
 
 
785 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  25.72 
 
 
784 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  26.2 
 
 
784 aa  343  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  25.72 
 
 
784 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  25.96 
 
 
784 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  25.96 
 
 
784 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  25.84 
 
 
784 aa  341  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  26.46 
 
 
784 aa  340  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  25.72 
 
 
784 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  37.27 
 
 
370 aa  255  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  39.43 
 
 
343 aa  253  7e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  37.46 
 
 
361 aa  251  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  36.46 
 
 
370 aa  251  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  37.75 
 
 
361 aa  251  3e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  37.46 
 
 
361 aa  251  5e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  35.51 
 
 
392 aa  248  4e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  33.94 
 
 
399 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  35.92 
 
 
370 aa  242  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  38.86 
 
 
347 aa  233  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  36.5 
 
 
348 aa  231  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  33.58 
 
 
392 aa  227  6e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  41.52 
 
 
346 aa  227  7e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  35.57 
 
 
347 aa  226  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  36.49 
 
 
367 aa  224  4e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  35.91 
 
 
349 aa  224  4e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  35.54 
 
 
366 aa  223  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  30.87 
 
 
392 aa  212  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  36.01 
 
 
389 aa  211  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  31.52 
 
 
387 aa  211  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  35.88 
 
 
388 aa  209  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  31.01 
 
 
387 aa  207  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  37.05 
 
 
329 aa  206  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  33.69 
 
 
359 aa  203  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  34.04 
 
 
363 aa  203  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  31.01 
 
 
387 aa  201  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  34.38 
 
 
392 aa  200  9e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  34.52 
 
 
381 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
389 aa  198  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.81 
 
 
392 aa  197  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  31.93 
 
 
370 aa  197  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  32.86 
 
 
392 aa  197  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4734  nucleotidyl transferase  31.82 
 
 
359 aa  196  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261092  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.52 
 
 
392 aa  196  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.52 
 
 
392 aa  196  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  32.1 
 
 
357 aa  194  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  32.84 
 
 
388 aa  193  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  32.95 
 
 
392 aa  193  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7616  Nucleotidyl transferase  31.34 
 
 
364 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0702464  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  33.16 
 
 
365 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  31.73 
 
 
392 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  33.72 
 
 
389 aa  192  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  32.95 
 
 
392 aa  192  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  31.73 
 
 
392 aa  190  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13293  D-alpha-D-mannose-1-phosphate guanylyltransferase manB  32 
 
 
359 aa  188  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.580301 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  33.63 
 
 
392 aa  188  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0967  nucleotidyl transferase  32 
 
 
407 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117198  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>