More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1202 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1202  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
393 aa  785    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3048  Nucleotidyl transferase  80.15 
 
 
393 aa  649    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.916197  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5109  Nucleotidyl transferase  80.92 
 
 
393 aa  632  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.000303329  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2065  Nucleotidyl transferase  69.47 
 
 
393 aa  558  1e-158  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2917  Nucleotidyl transferase  67.18 
 
 
439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.118183  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2874  Nucleotidyl transferase  56.97 
 
 
402 aa  409  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1083  Nucleotidyl transferase  55.61 
 
 
402 aa  398  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2341  nucleotidyl transferase  46.33 
 
 
396 aa  353  4e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00221584  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2020  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  42.96 
 
 
397 aa  340  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0399  nucleotidyl transferase  41.15 
 
 
414 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0280  Nucleotidyl transferase  41.22 
 
 
400 aa  312  5.999999999999999e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0529  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  44.42 
 
 
400 aa  312  7.999999999999999e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0505  nucleotidyl transferase  43.4 
 
 
400 aa  310  4e-83  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2229  nucleotidyl transferase  41.22 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1583  nucleotidyl transferase  39.7 
 
 
411 aa  299  5e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.605878  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0666  hypothetical protein  40.1 
 
 
399 aa  298  8e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0329  nucleotidyl transferase  38.94 
 
 
411 aa  298  2e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.175272  hitchhiker  0.000673657 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_470  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  41.88 
 
 
400 aa  296  4e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0254  nucleotidyl transferase  41.98 
 
 
399 aa  295  6e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0642  nucleotidyl transferase  38 
 
 
411 aa  295  1e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.163683  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0901  nucleotidyl transferase  42.5 
 
 
403 aa  293  3e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0513  nucleotidyl transferase  39.53 
 
 
411 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2853  nucleotidyl transferase  40.66 
 
 
401 aa  291  1e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.218905 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0314  Nucleotidyl transferase  37.66 
 
 
400 aa  277  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.42611 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1801  Nucleotidyl transferase  38.32 
 
 
403 aa  266  5.999999999999999e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0230412  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0068  nucleotidyl transferase  39.65 
 
 
404 aa  264  2e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0170821  normal  0.011821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2023  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  31.85 
 
 
405 aa  203  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.562906 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1630  Nucleotidyl transferase  36.78 
 
 
397 aa  203  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2344  nucleotidyl transferase  32.19 
 
 
405 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00861405  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0991  Nucleotidyl transferase  33.92 
 
 
397 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0530  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  32.63 
 
 
393 aa  194  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.911327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_471  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  34.15 
 
 
393 aa  192  9e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1679  nucleotidyl transferase  37.05 
 
 
374 aa  192  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0506  nucleotidyl transferase  34.15 
 
 
393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1080  Nucleotidyl transferase  36.99 
 
 
391 aa  188  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.380619 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0920  Nucleotidyl transferase  33.17 
 
 
391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0253  nucleotidyl transferase  33.06 
 
 
384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1845  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.44 
 
 
349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0548966  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2143  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.71 
 
 
357 aa  176  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.591307  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0665  glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase / UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  31.25 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2230  nucleotidyl transferase  33.43 
 
 
383 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2516  Nucleotidyl transferase  37.46 
 
 
388 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2854  nucleotidyl transferase  30.18 
 
 
388 aa  167  4e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1223  Nucleotidyl transferase  32.84 
 
 
392 aa  163  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2166  Nucleotidyl transferase  33.33 
 
 
387 aa  160  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0313  Nucleotidyl transferase  28.81 
 
 
384 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.414969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5787  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  36.61 
 
 
358 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0631  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  35.99 
 
 
355 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2643  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  38.06 
 
 
354 aa  157  4e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.84 
 
 
357 aa  157  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2794  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  35.37 
 
 
354 aa  156  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.181075 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1800  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  30.63 
 
 
357 aa  156  7e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.04 
 
 
355 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32360  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase /glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  32.46 
 
 
492 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.305815 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0923  nucleotidyl transferase  31.91 
 
 
325 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000758587  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0340  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.44 
 
 
355 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.830656  normal  0.0393179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3642  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase  31.8 
 
 
454 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0848816  normal  0.0657108 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0065  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.45 
 
 
355 aa  152  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1817  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.23 
 
 
355 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1639  Nucleotidyl transferase  29.24 
 
 
325 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4165  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.9 
 
 
355 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4128  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.23 
 
 
355 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0631243  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0733  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.93 
 
 
355 aa  151  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2508  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.65 
 
 
344 aa  150  3e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1546  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  29.31 
 
 
349 aa  150  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000479594  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0258  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.04 
 
 
356 aa  150  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  39.29 
 
 
247 aa  149  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  31.93 
 
 
325 aa  149  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0954  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.53 
 
 
354 aa  149  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.526326  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1214  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.93 
 
 
355 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4237  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  28.67 
 
 
454 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.016963  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2034  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.73 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  28.39 
 
 
361 aa  146  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0628  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.88 
 
 
358 aa  146  6e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.437993  normal  0.532658 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1450  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  32.74 
 
 
376 aa  146  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0814  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.67 
 
 
269 aa  146  8.000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.190345 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  31.1 
 
 
325 aa  145  9e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0124  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  28.05 
 
 
351 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000322504 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  29.07 
 
 
392 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0285  Nucleotidyl transferase  28.66 
 
 
385 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1687  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  34.73 
 
 
356 aa  144  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0075  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  31.65 
 
 
460 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2945  Nucleotidyl transferase  35.97 
 
 
248 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2754  glucose-1-phosphate thymidyltransferase  33.83 
 
 
355 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1431  Nucleotidyl transferase  36.61 
 
 
253 aa  144  3e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6491  dTDP-glucose pyrophosphorylase-like protein  33.93 
 
 
355 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1633  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.09 
 
 
224 aa  142  7e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  29.54 
 
 
326 aa  142  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0177  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase protein  30.43 
 
 
455 aa  142  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.221118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6354  UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase  29.6 
 
 
454 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2813  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  27.9 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4197  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  29.84 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73220  glucosamine-1-phosphate acetyltransferase/N-acetyl  29.6 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4895  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  27.95 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.508264  normal  0.342908 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2243  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.04 
 
 
453 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.164463  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0337  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.04 
 
 
453 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.116008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  32.34 
 
 
366 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3051  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.04 
 
 
453 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0324  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.04 
 
 
453 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2041  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30.26 
 
 
561 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>